Protein–RNA interactions for Protein: Q0GA42

Cnnm1, Metal transporter CNNM1, mousemouse

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm1Q0GA42 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cnnm1Q0GA42 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cnnm1Q0GA42 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cnnm1Q0GA42 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cnnm1Q0GA42 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cnnm1Q0GA42 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cnnm1Q0GA42 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cnnm1Q0GA42 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cnnm1Q0GA42 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Cnnm1Q0GA42 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Cnnm1Q0GA42 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cnnm1Q0GA42 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cnnm1Q0GA42 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cnnm1Q0GA42 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Cnnm1Q0GA42 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Cnnm1Q0GA42 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Cnnm1Q0GA42 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cnnm1Q0GA42 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cnnm1Q0GA42 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cnnm1Q0GA42 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cnnm1Q0GA42 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cnnm1Q0GA42 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cnnm1Q0GA42 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cnnm1Q0GA42 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cnnm1Q0GA42 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Cnnm1Q0GA42 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cnnm1Q0GA42 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cnnm1Q0GA42 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cnnm1Q0GA42 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Cnnm1Q0GA42 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cnnm1Q0GA42 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cnnm1Q0GA42 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cnnm1Q0GA42 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cnnm1Q0GA42 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cnnm1Q0GA42 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cnnm1Q0GA42 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cnnm1Q0GA42 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cnnm1Q0GA42 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cnnm1Q0GA42 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cnnm1Q0GA42 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cnnm1Q0GA42 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cnnm1Q0GA42 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cnnm1Q0GA42 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cnnm1Q0GA42 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cnnm1Q0GA42 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cnnm1Q0GA42 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cnnm1Q0GA42 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cnnm1Q0GA42 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cnnm1Q0GA42 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cnnm1Q0GA42 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cnnm1Q0GA42 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cnnm1Q0GA42 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cnnm1Q0GA42 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cnnm1Q0GA42 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cnnm1Q0GA42 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cnnm1Q0GA42 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cnnm1Q0GA42 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cnnm1Q0GA42 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cnnm1Q0GA42 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cnnm1Q0GA42 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cnnm1Q0GA42 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cnnm1Q0GA42 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cnnm1Q0GA42 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cnnm1Q0GA42 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cnnm1Q0GA42 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cnnm1Q0GA42 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cnnm1Q0GA42 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cnnm1Q0GA42 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cnnm1Q0GA42 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cnnm1Q0GA42 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cnnm1Q0GA42 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cnnm1Q0GA42 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cnnm1Q0GA42 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cnnm1Q0GA42 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cnnm1Q0GA42 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cnnm1Q0GA42 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cnnm1Q0GA42 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cnnm1Q0GA42 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cnnm1Q0GA42 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cnnm1Q0GA42 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cnnm1Q0GA42 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cnnm1Q0GA42 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cnnm1Q0GA42 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cnnm1Q0GA42 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cnnm1Q0GA42 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cnnm1Q0GA42 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cnnm1Q0GA42 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cnnm1Q0GA42 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cnnm1Q0GA42 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cnnm1Q0GA42 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cnnm1Q0GA42 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cnnm1Q0GA42 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cnnm1Q0GA42 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cnnm1Q0GA42 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cnnm1Q0GA42 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cnnm1Q0GA42 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cnnm1Q0GA42 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cnnm1Q0GA42 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cnnm1Q0GA42 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cnnm1Q0GA42 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms