Protein–RNA interactions for Protein: Q09098

Pate4, Prostate and testis expressed protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate4Q09098 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Pate4Q09098 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pate4Q09098 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pate4Q09098 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pate4Q09098 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pate4Q09098 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pate4Q09098 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pate4Q09098 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pate4Q09098 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pate4Q09098 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pate4Q09098 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Pate4Q09098 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pate4Q09098 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pate4Q09098 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pate4Q09098 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pate4Q09098 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pate4Q09098 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pate4Q09098 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pate4Q09098 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pate4Q09098 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pate4Q09098 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pate4Q09098 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pate4Q09098 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pate4Q09098 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pate4Q09098 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pate4Q09098 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pate4Q09098 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pate4Q09098 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pate4Q09098 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pate4Q09098 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pate4Q09098 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pate4Q09098 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pate4Q09098 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pate4Q09098 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pate4Q09098 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pate4Q09098 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pate4Q09098 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pate4Q09098 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pate4Q09098 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Pate4Q09098 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Pate4Q09098 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pate4Q09098 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pate4Q09098 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pate4Q09098 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pate4Q09098 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Pate4Q09098 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pate4Q09098 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Pate4Q09098 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pate4Q09098 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pate4Q09098 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pate4Q09098 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pate4Q09098 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pate4Q09098 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pate4Q09098 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pate4Q09098 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pate4Q09098 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pate4Q09098 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pate4Q09098 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pate4Q09098 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pate4Q09098 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pate4Q09098 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pate4Q09098 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pate4Q09098 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pate4Q09098 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pate4Q09098 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pate4Q09098 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pate4Q09098 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pate4Q09098 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pate4Q09098 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pate4Q09098 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pate4Q09098 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Pate4Q09098 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pate4Q09098 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pate4Q09098 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Pate4Q09098 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pate4Q09098 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pate4Q09098 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pate4Q09098 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pate4Q09098 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pate4Q09098 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pate4Q09098 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pate4Q09098 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pate4Q09098 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pate4Q09098 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pate4Q09098 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pate4Q09098 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pate4Q09098 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pate4Q09098 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pate4Q09098 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pate4Q09098 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pate4Q09098 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pate4Q09098 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pate4Q09098 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pate4Q09098 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Pate4Q09098 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pate4Q09098 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pate4Q09098 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pate4Q09098 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pate4Q09098 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pate4Q09098 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms