Protein–RNA interactions for Protein: Q08EE8

1700061G19Rik, RIKEN cDNA 1700061G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700061G19RikQ08EE8 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
1700061G19RikQ08EE8 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
1700061G19RikQ08EE8 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
1700061G19RikQ08EE8 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
1700061G19RikQ08EE8 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
1700061G19RikQ08EE8 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
1700061G19RikQ08EE8 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
1700061G19RikQ08EE8 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
1700061G19RikQ08EE8 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
1700061G19RikQ08EE8 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
1700061G19RikQ08EE8 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
1700061G19RikQ08EE8 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
1700061G19RikQ08EE8 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
1700061G19RikQ08EE8 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
1700061G19RikQ08EE8 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
1700061G19RikQ08EE8 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
1700061G19RikQ08EE8 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
1700061G19RikQ08EE8 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
1700061G19RikQ08EE8 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
1700061G19RikQ08EE8 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
1700061G19RikQ08EE8 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
1700061G19RikQ08EE8 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
1700061G19RikQ08EE8 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
1700061G19RikQ08EE8 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
1700061G19RikQ08EE8 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
1700061G19RikQ08EE8 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
1700061G19RikQ08EE8 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
1700061G19RikQ08EE8 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
1700061G19RikQ08EE8 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
1700061G19RikQ08EE8 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
1700061G19RikQ08EE8 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
1700061G19RikQ08EE8 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
1700061G19RikQ08EE8 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
1700061G19RikQ08EE8 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
1700061G19RikQ08EE8 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
1700061G19RikQ08EE8 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
1700061G19RikQ08EE8 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
1700061G19RikQ08EE8 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
1700061G19RikQ08EE8 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
1700061G19RikQ08EE8 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
1700061G19RikQ08EE8 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
1700061G19RikQ08EE8 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
1700061G19RikQ08EE8 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
1700061G19RikQ08EE8 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
1700061G19RikQ08EE8 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
1700061G19RikQ08EE8 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
1700061G19RikQ08EE8 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
1700061G19RikQ08EE8 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
1700061G19RikQ08EE8 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
1700061G19RikQ08EE8 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
1700061G19RikQ08EE8 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
1700061G19RikQ08EE8 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
1700061G19RikQ08EE8 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
1700061G19RikQ08EE8 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
1700061G19RikQ08EE8 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
1700061G19RikQ08EE8 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
1700061G19RikQ08EE8 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
1700061G19RikQ08EE8 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
1700061G19RikQ08EE8 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
1700061G19RikQ08EE8 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
1700061G19RikQ08EE8 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
1700061G19RikQ08EE8 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
1700061G19RikQ08EE8 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
1700061G19RikQ08EE8 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
1700061G19RikQ08EE8 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
1700061G19RikQ08EE8 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
1700061G19RikQ08EE8 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
1700061G19RikQ08EE8 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
1700061G19RikQ08EE8 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
1700061G19RikQ08EE8 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
1700061G19RikQ08EE8 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
1700061G19RikQ08EE8 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
1700061G19RikQ08EE8 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
1700061G19RikQ08EE8 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
1700061G19RikQ08EE8 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
1700061G19RikQ08EE8 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
1700061G19RikQ08EE8 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
1700061G19RikQ08EE8 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
1700061G19RikQ08EE8 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
1700061G19RikQ08EE8 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
1700061G19RikQ08EE8 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
1700061G19RikQ08EE8 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
1700061G19RikQ08EE8 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
1700061G19RikQ08EE8 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
1700061G19RikQ08EE8 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
1700061G19RikQ08EE8 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
1700061G19RikQ08EE8 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
1700061G19RikQ08EE8 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
1700061G19RikQ08EE8 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
1700061G19RikQ08EE8 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
1700061G19RikQ08EE8 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
1700061G19RikQ08EE8 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
1700061G19RikQ08EE8 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
1700061G19RikQ08EE8 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
1700061G19RikQ08EE8 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
1700061G19RikQ08EE8 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
1700061G19RikQ08EE8 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
1700061G19RikQ08EE8 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
1700061G19RikQ08EE8 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
1700061G19RikQ08EE8 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.6 ms