Protein–RNA interactions for Protein: Q08EC4

Cass4, Cas scaffolding protein family member 4, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cass4Q08EC4 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cass4Q08EC4 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cass4Q08EC4 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cass4Q08EC4 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cass4Q08EC4 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cass4Q08EC4 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cass4Q08EC4 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cass4Q08EC4 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cass4Q08EC4 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cass4Q08EC4 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cass4Q08EC4 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cass4Q08EC4 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cass4Q08EC4 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cass4Q08EC4 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cass4Q08EC4 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cass4Q08EC4 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cass4Q08EC4 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cass4Q08EC4 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cass4Q08EC4 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cass4Q08EC4 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cass4Q08EC4 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cass4Q08EC4 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cass4Q08EC4 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cass4Q08EC4 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cass4Q08EC4 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cass4Q08EC4 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cass4Q08EC4 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cass4Q08EC4 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cass4Q08EC4 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cass4Q08EC4 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cass4Q08EC4 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cass4Q08EC4 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cass4Q08EC4 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cass4Q08EC4 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cass4Q08EC4 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cass4Q08EC4 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cass4Q08EC4 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cass4Q08EC4 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cass4Q08EC4 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cass4Q08EC4 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cass4Q08EC4 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cass4Q08EC4 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cass4Q08EC4 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cass4Q08EC4 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cass4Q08EC4 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cass4Q08EC4 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cass4Q08EC4 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cass4Q08EC4 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cass4Q08EC4 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cass4Q08EC4 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cass4Q08EC4 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cass4Q08EC4 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cass4Q08EC4 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cass4Q08EC4 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cass4Q08EC4 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cass4Q08EC4 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cass4Q08EC4 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cass4Q08EC4 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cass4Q08EC4 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cass4Q08EC4 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cass4Q08EC4 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cass4Q08EC4 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cass4Q08EC4 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cass4Q08EC4 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cass4Q08EC4 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cass4Q08EC4 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cass4Q08EC4 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cass4Q08EC4 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cass4Q08EC4 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cass4Q08EC4 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cass4Q08EC4 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cass4Q08EC4 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cass4Q08EC4 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cass4Q08EC4 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cass4Q08EC4 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cass4Q08EC4 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cass4Q08EC4 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cass4Q08EC4 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cass4Q08EC4 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cass4Q08EC4 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cass4Q08EC4 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cass4Q08EC4 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cass4Q08EC4 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cass4Q08EC4 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cass4Q08EC4 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cass4Q08EC4 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cass4Q08EC4 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cass4Q08EC4 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Cass4Q08EC4 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cass4Q08EC4 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Cass4Q08EC4 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cass4Q08EC4 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cass4Q08EC4 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cass4Q08EC4 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cass4Q08EC4 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cass4Q08EC4 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cass4Q08EC4 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cass4Q08EC4 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cass4Q08EC4 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cass4Q08EC4 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms