Protein–RNA interactions for Protein: Q08624

Hoxc4, Homeobox protein Hox-C4, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc4Q08624 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxc4Q08624 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxc4Q08624 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxc4Q08624 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxc4Q08624 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxc4Q08624 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxc4Q08624 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxc4Q08624 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxc4Q08624 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxc4Q08624 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxc4Q08624 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxc4Q08624 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxc4Q08624 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxc4Q08624 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxc4Q08624 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxc4Q08624 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxc4Q08624 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxc4Q08624 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxc4Q08624 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxc4Q08624 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxc4Q08624 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxc4Q08624 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxc4Q08624 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxc4Q08624 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxc4Q08624 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxc4Q08624 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxc4Q08624 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxc4Q08624 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxc4Q08624 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxc4Q08624 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxc4Q08624 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxc4Q08624 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxc4Q08624 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxc4Q08624 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxc4Q08624 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxc4Q08624 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxc4Q08624 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxc4Q08624 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxc4Q08624 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxc4Q08624 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxc4Q08624 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Hoxc4Q08624 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Hoxc4Q08624 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxc4Q08624 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxc4Q08624 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxc4Q08624 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxc4Q08624 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxc4Q08624 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxc4Q08624 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxc4Q08624 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxc4Q08624 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxc4Q08624 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxc4Q08624 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxc4Q08624 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxc4Q08624 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxc4Q08624 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxc4Q08624 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxc4Q08624 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxc4Q08624 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxc4Q08624 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxc4Q08624 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxc4Q08624 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxc4Q08624 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxc4Q08624 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxc4Q08624 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxc4Q08624 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxc4Q08624 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxc4Q08624 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxc4Q08624 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxc4Q08624 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxc4Q08624 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxc4Q08624 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxc4Q08624 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxc4Q08624 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxc4Q08624 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxc4Q08624 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxc4Q08624 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxc4Q08624 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxc4Q08624 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxc4Q08624 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxc4Q08624 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxc4Q08624 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxc4Q08624 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxc4Q08624 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxc4Q08624 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxc4Q08624 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxc4Q08624 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxc4Q08624 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxc4Q08624 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxc4Q08624 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxc4Q08624 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxc4Q08624 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxc4Q08624 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxc4Q08624 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxc4Q08624 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxc4Q08624 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxc4Q08624 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxc4Q08624 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxc4Q08624 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxc4Q08624 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms