Protein–RNA interactions for Protein: Q08423

Tff1, Trefoil factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 87 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff1Q08423 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tff1Q08423 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tff1Q08423 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tff1Q08423 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tff1Q08423 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tff1Q08423 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tff1Q08423 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tff1Q08423 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tff1Q08423 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tff1Q08423 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tff1Q08423 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Tff1Q08423 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tff1Q08423 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tff1Q08423 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tff1Q08423 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tff1Q08423 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tff1Q08423 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tff1Q08423 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tff1Q08423 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Tff1Q08423 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tff1Q08423 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tff1Q08423 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Tff1Q08423 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tff1Q08423 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tff1Q08423 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tff1Q08423 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tff1Q08423 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tff1Q08423 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tff1Q08423 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tff1Q08423 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tff1Q08423 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tff1Q08423 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tff1Q08423 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tff1Q08423 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tff1Q08423 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tff1Q08423 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tff1Q08423 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tff1Q08423 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tff1Q08423 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tff1Q08423 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tff1Q08423 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tff1Q08423 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tff1Q08423 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tff1Q08423 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tff1Q08423 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tff1Q08423 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tff1Q08423 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tff1Q08423 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tff1Q08423 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tff1Q08423 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tff1Q08423 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tff1Q08423 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tff1Q08423 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tff1Q08423 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tff1Q08423 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tff1Q08423 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tff1Q08423 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tff1Q08423 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tff1Q08423 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tff1Q08423 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tff1Q08423 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tff1Q08423 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tff1Q08423 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tff1Q08423 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tff1Q08423 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tff1Q08423 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tff1Q08423 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tff1Q08423 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tff1Q08423 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tff1Q08423 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tff1Q08423 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Tff1Q08423 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tff1Q08423 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tff1Q08423 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tff1Q08423 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tff1Q08423 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tff1Q08423 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tff1Q08423 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tff1Q08423 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tff1Q08423 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tff1Q08423 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tff1Q08423 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tff1Q08423 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tff1Q08423 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tff1Q08423 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tff1Q08423 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tff1Q08423 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tff1Q08423 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tff1Q08423 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tff1Q08423 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tff1Q08423 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tff1Q08423 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tff1Q08423 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tff1Q08423 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tff1Q08423 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Tff1Q08423 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tff1Q08423 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tff1Q08423 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tff1Q08423 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tff1Q08423 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms