Protein–RNA interactions for Protein: Q08331

Calb2, Calretinin, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb2Q08331 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Calb2Q08331 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Calb2Q08331 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Calb2Q08331 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Calb2Q08331 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Calb2Q08331 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Calb2Q08331 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Calb2Q08331 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Calb2Q08331 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Calb2Q08331 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Calb2Q08331 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Calb2Q08331 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Calb2Q08331 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Calb2Q08331 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Calb2Q08331 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Calb2Q08331 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Calb2Q08331 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Calb2Q08331 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Calb2Q08331 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Calb2Q08331 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Calb2Q08331 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Calb2Q08331 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Calb2Q08331 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Calb2Q08331 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Calb2Q08331 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Calb2Q08331 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Calb2Q08331 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Calb2Q08331 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Calb2Q08331 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Calb2Q08331 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Calb2Q08331 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Calb2Q08331 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Calb2Q08331 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Calb2Q08331 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Calb2Q08331 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Calb2Q08331 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Calb2Q08331 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Calb2Q08331 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Calb2Q08331 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Calb2Q08331 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Calb2Q08331 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Calb2Q08331 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Calb2Q08331 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Calb2Q08331 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Calb2Q08331 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Calb2Q08331 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Calb2Q08331 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Calb2Q08331 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Calb2Q08331 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Calb2Q08331 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Calb2Q08331 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Calb2Q08331 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Calb2Q08331 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Calb2Q08331 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Calb2Q08331 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Calb2Q08331 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Calb2Q08331 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Calb2Q08331 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Calb2Q08331 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Calb2Q08331 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Calb2Q08331 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Calb2Q08331 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Calb2Q08331 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Calb2Q08331 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Calb2Q08331 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Calb2Q08331 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Calb2Q08331 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Calb2Q08331 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Calb2Q08331 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Calb2Q08331 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Calb2Q08331 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Calb2Q08331 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Calb2Q08331 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Calb2Q08331 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Calb2Q08331 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Calb2Q08331 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Calb2Q08331 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Calb2Q08331 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Calb2Q08331 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Calb2Q08331 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Calb2Q08331 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Calb2Q08331 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Calb2Q08331 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Calb2Q08331 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Calb2Q08331 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Calb2Q08331 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Calb2Q08331 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Calb2Q08331 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Calb2Q08331 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Calb2Q08331 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Calb2Q08331 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Calb2Q08331 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Calb2Q08331 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Calb2Q08331 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Calb2Q08331 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Calb2Q08331 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Calb2Q08331 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Calb2Q08331 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Calb2Q08331 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Calb2Q08331 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms