Protein–RNA interactions for Protein: Q08024

Cbfb, Core-binding factor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CbfbQ08024 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CbfbQ08024 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CbfbQ08024 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CbfbQ08024 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CbfbQ08024 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CbfbQ08024 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CbfbQ08024 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CbfbQ08024 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CbfbQ08024 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CbfbQ08024 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CbfbQ08024 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CbfbQ08024 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CbfbQ08024 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CbfbQ08024 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CbfbQ08024 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CbfbQ08024 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CbfbQ08024 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CbfbQ08024 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CbfbQ08024 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CbfbQ08024 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CbfbQ08024 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CbfbQ08024 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CbfbQ08024 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CbfbQ08024 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CbfbQ08024 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CbfbQ08024 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CbfbQ08024 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CbfbQ08024 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CbfbQ08024 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CbfbQ08024 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CbfbQ08024 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CbfbQ08024 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CbfbQ08024 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CbfbQ08024 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CbfbQ08024 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CbfbQ08024 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CbfbQ08024 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CbfbQ08024 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CbfbQ08024 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CbfbQ08024 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CbfbQ08024 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CbfbQ08024 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CbfbQ08024 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CbfbQ08024 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CbfbQ08024 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CbfbQ08024 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CbfbQ08024 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CbfbQ08024 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CbfbQ08024 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CbfbQ08024 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CbfbQ08024 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CbfbQ08024 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CbfbQ08024 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CbfbQ08024 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CbfbQ08024 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CbfbQ08024 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CbfbQ08024 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CbfbQ08024 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CbfbQ08024 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CbfbQ08024 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CbfbQ08024 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CbfbQ08024 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CbfbQ08024 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CbfbQ08024 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CbfbQ08024 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CbfbQ08024 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CbfbQ08024 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CbfbQ08024 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CbfbQ08024 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CbfbQ08024 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CbfbQ08024 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CbfbQ08024 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CbfbQ08024 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CbfbQ08024 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CbfbQ08024 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CbfbQ08024 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CbfbQ08024 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CbfbQ08024 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CbfbQ08024 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CbfbQ08024 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CbfbQ08024 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CbfbQ08024 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CbfbQ08024 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CbfbQ08024 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CbfbQ08024 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CbfbQ08024 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CbfbQ08024 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CbfbQ08024 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CbfbQ08024 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CbfbQ08024 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CbfbQ08024 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CbfbQ08024 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CbfbQ08024 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CbfbQ08024 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CbfbQ08024 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CbfbQ08024 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CbfbQ08024 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CbfbQ08024 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CbfbQ08024 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CbfbQ08024 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms