Protein–RNA interactions for Protein: Q07916

Pou6f1, POU domain, class 6, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou6f1Q07916 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pou6f1Q07916 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pou6f1Q07916 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pou6f1Q07916 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pou6f1Q07916 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pou6f1Q07916 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pou6f1Q07916 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pou6f1Q07916 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pou6f1Q07916 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pou6f1Q07916 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pou6f1Q07916 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Pou6f1Q07916 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Pou6f1Q07916 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pou6f1Q07916 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pou6f1Q07916 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pou6f1Q07916 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pou6f1Q07916 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pou6f1Q07916 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pou6f1Q07916 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pou6f1Q07916 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pou6f1Q07916 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pou6f1Q07916 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pou6f1Q07916 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pou6f1Q07916 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pou6f1Q07916 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pou6f1Q07916 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pou6f1Q07916 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pou6f1Q07916 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pou6f1Q07916 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pou6f1Q07916 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pou6f1Q07916 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pou6f1Q07916 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pou6f1Q07916 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pou6f1Q07916 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pou6f1Q07916 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pou6f1Q07916 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pou6f1Q07916 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pou6f1Q07916 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pou6f1Q07916 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pou6f1Q07916 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Pou6f1Q07916 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pou6f1Q07916 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pou6f1Q07916 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pou6f1Q07916 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pou6f1Q07916 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pou6f1Q07916 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pou6f1Q07916 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pou6f1Q07916 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pou6f1Q07916 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pou6f1Q07916 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pou6f1Q07916 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pou6f1Q07916 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pou6f1Q07916 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pou6f1Q07916 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Pou6f1Q07916 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pou6f1Q07916 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pou6f1Q07916 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pou6f1Q07916 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Pou6f1Q07916 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pou6f1Q07916 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pou6f1Q07916 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pou6f1Q07916 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pou6f1Q07916 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pou6f1Q07916 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pou6f1Q07916 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pou6f1Q07916 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pou6f1Q07916 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pou6f1Q07916 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pou6f1Q07916 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pou6f1Q07916 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Pou6f1Q07916 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pou6f1Q07916 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pou6f1Q07916 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pou6f1Q07916 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pou6f1Q07916 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pou6f1Q07916 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pou6f1Q07916 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pou6f1Q07916 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pou6f1Q07916 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pou6f1Q07916 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pou6f1Q07916 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pou6f1Q07916 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pou6f1Q07916 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pou6f1Q07916 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pou6f1Q07916 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pou6f1Q07916 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Pou6f1Q07916 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Pou6f1Q07916 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pou6f1Q07916 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pou6f1Q07916 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pou6f1Q07916 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pou6f1Q07916 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pou6f1Q07916 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pou6f1Q07916 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pou6f1Q07916 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pou6f1Q07916 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pou6f1Q07916 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pou6f1Q07916 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pou6f1Q07916 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Pou6f1Q07916 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms