Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cntn3Q07409 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cntn3Q07409 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cntn3Q07409 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cntn3Q07409 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cntn3Q07409 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cntn3Q07409 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cntn3Q07409 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cntn3Q07409 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cntn3Q07409 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cntn3Q07409 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cntn3Q07409 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cntn3Q07409 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cntn3Q07409 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cntn3Q07409 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cntn3Q07409 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cntn3Q07409 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cntn3Q07409 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cntn3Q07409 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cntn3Q07409 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cntn3Q07409 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cntn3Q07409 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cntn3Q07409 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cntn3Q07409 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cntn3Q07409 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cntn3Q07409 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cntn3Q07409 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cntn3Q07409 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cntn3Q07409 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cntn3Q07409 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cntn3Q07409 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cntn3Q07409 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cntn3Q07409 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cntn3Q07409 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cntn3Q07409 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cntn3Q07409 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cntn3Q07409 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cntn3Q07409 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cntn3Q07409 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Cntn3Q07409 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cntn3Q07409 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cntn3Q07409 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cntn3Q07409 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Cntn3Q07409 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cntn3Q07409 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cntn3Q07409 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cntn3Q07409 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cntn3Q07409 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cntn3Q07409 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cntn3Q07409 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Cntn3Q07409 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Cntn3Q07409 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cntn3Q07409 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cntn3Q07409 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cntn3Q07409 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cntn3Q07409 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cntn3Q07409 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cntn3Q07409 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cntn3Q07409 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cntn3Q07409 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cntn3Q07409 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cntn3Q07409 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cntn3Q07409 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cntn3Q07409 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cntn3Q07409 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cntn3Q07409 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Cntn3Q07409 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Cntn3Q07409 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cntn3Q07409 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cntn3Q07409 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cntn3Q07409 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cntn3Q07409 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cntn3Q07409 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cntn3Q07409 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cntn3Q07409 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cntn3Q07409 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cntn3Q07409 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cntn3Q07409 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cntn3Q07409 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cntn3Q07409 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Cntn3Q07409 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cntn3Q07409 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Cntn3Q07409 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cntn3Q07409 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cntn3Q07409 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cntn3Q07409 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cntn3Q07409 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cntn3Q07409 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cntn3Q07409 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cntn3Q07409 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cntn3Q07409 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cntn3Q07409 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cntn3Q07409 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cntn3Q07409 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cntn3Q07409 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cntn3Q07409 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cntn3Q07409 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cntn3Q07409 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cntn3Q07409 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cntn3Q07409 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms