Protein–RNA interactions for Protein: Q07105

Gdf9, Growth/differentiation factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf9Q07105 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gdf9Q07105 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gdf9Q07105 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gdf9Q07105 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gdf9Q07105 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gdf9Q07105 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gdf9Q07105 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gdf9Q07105 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gdf9Q07105 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gdf9Q07105 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gdf9Q07105 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gdf9Q07105 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gdf9Q07105 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gdf9Q07105 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gdf9Q07105 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gdf9Q07105 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gdf9Q07105 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gdf9Q07105 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gdf9Q07105 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gdf9Q07105 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gdf9Q07105 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gdf9Q07105 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gdf9Q07105 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gdf9Q07105 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gdf9Q07105 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gdf9Q07105 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gdf9Q07105 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gdf9Q07105 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gdf9Q07105 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gdf9Q07105 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gdf9Q07105 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gdf9Q07105 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gdf9Q07105 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gdf9Q07105 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gdf9Q07105 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gdf9Q07105 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gdf9Q07105 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gdf9Q07105 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gdf9Q07105 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gdf9Q07105 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gdf9Q07105 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gdf9Q07105 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gdf9Q07105 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gdf9Q07105 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gdf9Q07105 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gdf9Q07105 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gdf9Q07105 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gdf9Q07105 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gdf9Q07105 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Gdf9Q07105 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gdf9Q07105 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gdf9Q07105 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gdf9Q07105 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Gdf9Q07105 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gdf9Q07105 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gdf9Q07105 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gdf9Q07105 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gdf9Q07105 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gdf9Q07105 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gdf9Q07105 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gdf9Q07105 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gdf9Q07105 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gdf9Q07105 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Gdf9Q07105 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gdf9Q07105 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gdf9Q07105 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gdf9Q07105 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gdf9Q07105 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Gdf9Q07105 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Gdf9Q07105 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Gdf9Q07105 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gdf9Q07105 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gdf9Q07105 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gdf9Q07105 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gdf9Q07105 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gdf9Q07105 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gdf9Q07105 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gdf9Q07105 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gdf9Q07105 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gdf9Q07105 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gdf9Q07105 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gdf9Q07105 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gdf9Q07105 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gdf9Q07105 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Gdf9Q07105 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gdf9Q07105 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Gdf9Q07105 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gdf9Q07105 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gdf9Q07105 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gdf9Q07105 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gdf9Q07105 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gdf9Q07105 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gdf9Q07105 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gdf9Q07105 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gdf9Q07105 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gdf9Q07105 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gdf9Q07105 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gdf9Q07105 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gdf9Q07105 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gdf9Q07105 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms