Protein–RNA interactions for Protein: Q07104

Gdf3, Growth/differentiation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf3Q07104 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gdf3Q07104 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gdf3Q07104 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gdf3Q07104 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gdf3Q07104 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gdf3Q07104 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gdf3Q07104 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gdf3Q07104 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gdf3Q07104 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gdf3Q07104 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gdf3Q07104 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gdf3Q07104 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gdf3Q07104 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gdf3Q07104 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gdf3Q07104 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gdf3Q07104 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gdf3Q07104 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gdf3Q07104 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gdf3Q07104 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gdf3Q07104 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gdf3Q07104 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gdf3Q07104 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gdf3Q07104 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gdf3Q07104 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gdf3Q07104 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gdf3Q07104 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gdf3Q07104 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gdf3Q07104 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gdf3Q07104 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gdf3Q07104 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gdf3Q07104 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gdf3Q07104 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gdf3Q07104 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gdf3Q07104 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gdf3Q07104 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gdf3Q07104 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gdf3Q07104 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gdf3Q07104 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gdf3Q07104 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gdf3Q07104 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gdf3Q07104 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gdf3Q07104 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gdf3Q07104 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gdf3Q07104 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gdf3Q07104 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gdf3Q07104 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gdf3Q07104 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gdf3Q07104 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gdf3Q07104 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gdf3Q07104 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gdf3Q07104 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gdf3Q07104 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gdf3Q07104 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gdf3Q07104 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gdf3Q07104 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gdf3Q07104 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gdf3Q07104 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gdf3Q07104 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gdf3Q07104 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gdf3Q07104 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gdf3Q07104 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gdf3Q07104 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gdf3Q07104 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gdf3Q07104 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gdf3Q07104 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gdf3Q07104 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gdf3Q07104 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gdf3Q07104 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gdf3Q07104 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gdf3Q07104 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gdf3Q07104 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gdf3Q07104 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gdf3Q07104 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gdf3Q07104 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gdf3Q07104 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gdf3Q07104 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gdf3Q07104 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gdf3Q07104 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gdf3Q07104 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gdf3Q07104 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gdf3Q07104 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gdf3Q07104 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gdf3Q07104 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gdf3Q07104 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gdf3Q07104 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gdf3Q07104 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gdf3Q07104 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gdf3Q07104 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gdf3Q07104 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gdf3Q07104 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gdf3Q07104 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gdf3Q07104 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gdf3Q07104 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gdf3Q07104 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gdf3Q07104 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gdf3Q07104 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gdf3Q07104 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gdf3Q07104 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gdf3Q07104 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gdf3Q07104 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms