Protein–RNA interactions for Protein: Q06890

Clu, Clusterin, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CluQ06890 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CluQ06890 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CluQ06890 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CluQ06890 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CluQ06890 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CluQ06890 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CluQ06890 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CluQ06890 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CluQ06890 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
CluQ06890 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CluQ06890 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CluQ06890 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CluQ06890 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CluQ06890 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CluQ06890 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CluQ06890 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CluQ06890 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CluQ06890 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CluQ06890 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CluQ06890 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CluQ06890 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CluQ06890 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CluQ06890 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CluQ06890 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CluQ06890 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CluQ06890 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CluQ06890 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CluQ06890 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CluQ06890 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CluQ06890 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CluQ06890 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CluQ06890 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CluQ06890 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CluQ06890 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CluQ06890 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CluQ06890 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CluQ06890 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CluQ06890 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CluQ06890 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
CluQ06890 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CluQ06890 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CluQ06890 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CluQ06890 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CluQ06890 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CluQ06890 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CluQ06890 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CluQ06890 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CluQ06890 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CluQ06890 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CluQ06890 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CluQ06890 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CluQ06890 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CluQ06890 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CluQ06890 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CluQ06890 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
CluQ06890 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CluQ06890 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CluQ06890 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CluQ06890 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
CluQ06890 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CluQ06890 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CluQ06890 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CluQ06890 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CluQ06890 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CluQ06890 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CluQ06890 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CluQ06890 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CluQ06890 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CluQ06890 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CluQ06890 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CluQ06890 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CluQ06890 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CluQ06890 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CluQ06890 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CluQ06890 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CluQ06890 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CluQ06890 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CluQ06890 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CluQ06890 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CluQ06890 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CluQ06890 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CluQ06890 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CluQ06890 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CluQ06890 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CluQ06890 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CluQ06890 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CluQ06890 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CluQ06890 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CluQ06890 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CluQ06890 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CluQ06890 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CluQ06890 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CluQ06890 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CluQ06890 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CluQ06890 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CluQ06890 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CluQ06890 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CluQ06890 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CluQ06890 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CluQ06890 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.7 ms