Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cab39Q06138 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cab39Q06138 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cab39Q06138 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cab39Q06138 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cab39Q06138 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cab39Q06138 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cab39Q06138 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cab39Q06138 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cab39Q06138 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cab39Q06138 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cab39Q06138 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cab39Q06138 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cab39Q06138 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cab39Q06138 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cab39Q06138 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cab39Q06138 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cab39Q06138 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cab39Q06138 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cab39Q06138 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cab39Q06138 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cab39Q06138 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cab39Q06138 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cab39Q06138 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cab39Q06138 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cab39Q06138 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cab39Q06138 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cab39Q06138 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cab39Q06138 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cab39Q06138 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cab39Q06138 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cab39Q06138 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cab39Q06138 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cab39Q06138 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cab39Q06138 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cab39Q06138 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cab39Q06138 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cab39Q06138 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cab39Q06138 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cab39Q06138 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cab39Q06138 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cab39Q06138 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cab39Q06138 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cab39Q06138 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cab39Q06138 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cab39Q06138 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cab39Q06138 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cab39Q06138 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cab39Q06138 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cab39Q06138 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cab39Q06138 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cab39Q06138 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cab39Q06138 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cab39Q06138 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cab39Q06138 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cab39Q06138 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cab39Q06138 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cab39Q06138 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cab39Q06138 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cab39Q06138 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cab39Q06138 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cab39Q06138 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cab39Q06138 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cab39Q06138 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cab39Q06138 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cab39Q06138 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cab39Q06138 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cab39Q06138 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cab39Q06138 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cab39Q06138 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cab39Q06138 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cab39Q06138 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cab39Q06138 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cab39Q06138 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cab39Q06138 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cab39Q06138 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cab39Q06138 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cab39Q06138 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cab39Q06138 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cab39Q06138 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cab39Q06138 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cab39Q06138 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cab39Q06138 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cab39Q06138 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cab39Q06138 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cab39Q06138 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cab39Q06138 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cab39Q06138 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cab39Q06138 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cab39Q06138 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cab39Q06138 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cab39Q06138 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cab39Q06138 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cab39Q06138 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cab39Q06138 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cab39Q06138 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cab39Q06138 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cab39Q06138 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cab39Q06138 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cab39Q06138 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms