Protein–RNA interactions for Protein: Q05A80

Caprin2, Caprin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,031 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Caprin2Q05A80 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Caprin2Q05A80 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Caprin2Q05A80 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Caprin2Q05A80 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Caprin2Q05A80 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Caprin2Q05A80 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Caprin2Q05A80 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Caprin2Q05A80 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Caprin2Q05A80 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Caprin2Q05A80 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Caprin2Q05A80 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Caprin2Q05A80 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Caprin2Q05A80 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Caprin2Q05A80 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Caprin2Q05A80 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Caprin2Q05A80 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Caprin2Q05A80 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Caprin2Q05A80 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Caprin2Q05A80 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Caprin2Q05A80 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Caprin2Q05A80 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Caprin2Q05A80 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Caprin2Q05A80 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Caprin2Q05A80 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Caprin2Q05A80 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Caprin2Q05A80 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Caprin2Q05A80 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Caprin2Q05A80 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Caprin2Q05A80 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Caprin2Q05A80 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Caprin2Q05A80 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Caprin2Q05A80 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Caprin2Q05A80 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Caprin2Q05A80 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Caprin2Q05A80 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Caprin2Q05A80 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Caprin2Q05A80 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Caprin2Q05A80 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Caprin2Q05A80 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Caprin2Q05A80 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Caprin2Q05A80 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Caprin2Q05A80 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Caprin2Q05A80 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Caprin2Q05A80 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Caprin2Q05A80 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Caprin2Q05A80 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Caprin2Q05A80 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Caprin2Q05A80 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Caprin2Q05A80 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Caprin2Q05A80 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Caprin2Q05A80 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Caprin2Q05A80 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Caprin2Q05A80 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Caprin2Q05A80 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Caprin2Q05A80 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Caprin2Q05A80 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Caprin2Q05A80 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Caprin2Q05A80 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Caprin2Q05A80 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Caprin2Q05A80 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Caprin2Q05A80 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Caprin2Q05A80 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Caprin2Q05A80 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Caprin2Q05A80 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Caprin2Q05A80 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Caprin2Q05A80 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Caprin2Q05A80 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Caprin2Q05A80 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Caprin2Q05A80 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Caprin2Q05A80 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Caprin2Q05A80 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Caprin2Q05A80 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Caprin2Q05A80 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Caprin2Q05A80 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Caprin2Q05A80 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Caprin2Q05A80 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Caprin2Q05A80 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Caprin2Q05A80 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Caprin2Q05A80 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Caprin2Q05A80 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Caprin2Q05A80 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Caprin2Q05A80 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Caprin2Q05A80 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Caprin2Q05A80 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Caprin2Q05A80 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Caprin2Q05A80 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Caprin2Q05A80 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Caprin2Q05A80 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Caprin2Q05A80 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Caprin2Q05A80 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Caprin2Q05A80 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Caprin2Q05A80 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Caprin2Q05A80 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Caprin2Q05A80 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Caprin2Q05A80 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Caprin2Q05A80 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Caprin2Q05A80 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Caprin2Q05A80 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Caprin2Q05A80 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Caprin2Q05A80 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms