Protein–RNA interactions for Protein: Q05909

Ptprg, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, mousemouse

Predictions only

Length 1,442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprgQ05909 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PtprgQ05909 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PtprgQ05909 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PtprgQ05909 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PtprgQ05909 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PtprgQ05909 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PtprgQ05909 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PtprgQ05909 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PtprgQ05909 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PtprgQ05909 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PtprgQ05909 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PtprgQ05909 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PtprgQ05909 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PtprgQ05909 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PtprgQ05909 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PtprgQ05909 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PtprgQ05909 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PtprgQ05909 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PtprgQ05909 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PtprgQ05909 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PtprgQ05909 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PtprgQ05909 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PtprgQ05909 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PtprgQ05909 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PtprgQ05909 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PtprgQ05909 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PtprgQ05909 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PtprgQ05909 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PtprgQ05909 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PtprgQ05909 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PtprgQ05909 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PtprgQ05909 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PtprgQ05909 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PtprgQ05909 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PtprgQ05909 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PtprgQ05909 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PtprgQ05909 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PtprgQ05909 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PtprgQ05909 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PtprgQ05909 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PtprgQ05909 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PtprgQ05909 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PtprgQ05909 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PtprgQ05909 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PtprgQ05909 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PtprgQ05909 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PtprgQ05909 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PtprgQ05909 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PtprgQ05909 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PtprgQ05909 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PtprgQ05909 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PtprgQ05909 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PtprgQ05909 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PtprgQ05909 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PtprgQ05909 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PtprgQ05909 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PtprgQ05909 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PtprgQ05909 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PtprgQ05909 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PtprgQ05909 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PtprgQ05909 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PtprgQ05909 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PtprgQ05909 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PtprgQ05909 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PtprgQ05909 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PtprgQ05909 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PtprgQ05909 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PtprgQ05909 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PtprgQ05909 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PtprgQ05909 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PtprgQ05909 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PtprgQ05909 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PtprgQ05909 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PtprgQ05909 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PtprgQ05909 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PtprgQ05909 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PtprgQ05909 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PtprgQ05909 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PtprgQ05909 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PtprgQ05909 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PtprgQ05909 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PtprgQ05909 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PtprgQ05909 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PtprgQ05909 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PtprgQ05909 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PtprgQ05909 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PtprgQ05909 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PtprgQ05909 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PtprgQ05909 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PtprgQ05909 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PtprgQ05909 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PtprgQ05909 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PtprgQ05909 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PtprgQ05909 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PtprgQ05909 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PtprgQ05909 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PtprgQ05909 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PtprgQ05909 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PtprgQ05909 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PtprgQ05909 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms