Protein–RNA interactions for Protein: Q05895

Thbs3, Thrombospondin-3, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs3Q05895 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thbs3Q05895 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thbs3Q05895 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thbs3Q05895 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thbs3Q05895 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thbs3Q05895 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thbs3Q05895 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thbs3Q05895 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Thbs3Q05895 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thbs3Q05895 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Thbs3Q05895 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Thbs3Q05895 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thbs3Q05895 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thbs3Q05895 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thbs3Q05895 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thbs3Q05895 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thbs3Q05895 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thbs3Q05895 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thbs3Q05895 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thbs3Q05895 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Thbs3Q05895 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thbs3Q05895 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thbs3Q05895 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thbs3Q05895 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thbs3Q05895 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thbs3Q05895 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thbs3Q05895 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thbs3Q05895 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thbs3Q05895 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Thbs3Q05895 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Thbs3Q05895 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thbs3Q05895 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Thbs3Q05895 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thbs3Q05895 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thbs3Q05895 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thbs3Q05895 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thbs3Q05895 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thbs3Q05895 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thbs3Q05895 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thbs3Q05895 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thbs3Q05895 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thbs3Q05895 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thbs3Q05895 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thbs3Q05895 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thbs3Q05895 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Thbs3Q05895 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thbs3Q05895 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Thbs3Q05895 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thbs3Q05895 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thbs3Q05895 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thbs3Q05895 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thbs3Q05895 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thbs3Q05895 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thbs3Q05895 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thbs3Q05895 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thbs3Q05895 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thbs3Q05895 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thbs3Q05895 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thbs3Q05895 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thbs3Q05895 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thbs3Q05895 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thbs3Q05895 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thbs3Q05895 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thbs3Q05895 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thbs3Q05895 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thbs3Q05895 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thbs3Q05895 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thbs3Q05895 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thbs3Q05895 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thbs3Q05895 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Thbs3Q05895 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thbs3Q05895 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thbs3Q05895 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thbs3Q05895 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thbs3Q05895 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thbs3Q05895 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Thbs3Q05895 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Thbs3Q05895 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Thbs3Q05895 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Thbs3Q05895 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Thbs3Q05895 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Thbs3Q05895 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Thbs3Q05895 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Thbs3Q05895 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Thbs3Q05895 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Thbs3Q05895 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Thbs3Q05895 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Thbs3Q05895 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Thbs3Q05895 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Thbs3Q05895 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Thbs3Q05895 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Thbs3Q05895 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Thbs3Q05895 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Thbs3Q05895 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Thbs3Q05895 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Thbs3Q05895 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Thbs3Q05895 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Thbs3Q05895 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Thbs3Q05895 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Thbs3Q05895 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms