Protein–RNA interactions for Protein: Q04692

Smarcad1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcad1Q04692 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Smarcad1Q04692 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Smarcad1Q04692 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Smarcad1Q04692 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Smarcad1Q04692 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Smarcad1Q04692 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Smarcad1Q04692 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Smarcad1Q04692 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Smarcad1Q04692 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Smarcad1Q04692 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Smarcad1Q04692 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Smarcad1Q04692 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Smarcad1Q04692 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Smarcad1Q04692 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Smarcad1Q04692 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Smarcad1Q04692 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Smarcad1Q04692 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Smarcad1Q04692 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Smarcad1Q04692 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Smarcad1Q04692 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Smarcad1Q04692 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Smarcad1Q04692 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Smarcad1Q04692 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Smarcad1Q04692 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Smarcad1Q04692 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Smarcad1Q04692 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Smarcad1Q04692 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Smarcad1Q04692 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Smarcad1Q04692 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Smarcad1Q04692 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Smarcad1Q04692 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Smarcad1Q04692 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Smarcad1Q04692 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Smarcad1Q04692 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Smarcad1Q04692 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Smarcad1Q04692 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Smarcad1Q04692 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Smarcad1Q04692 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Smarcad1Q04692 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Smarcad1Q04692 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Smarcad1Q04692 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Smarcad1Q04692 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Smarcad1Q04692 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Smarcad1Q04692 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Smarcad1Q04692 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Smarcad1Q04692 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Smarcad1Q04692 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Smarcad1Q04692 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Smarcad1Q04692 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Smarcad1Q04692 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Smarcad1Q04692 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Smarcad1Q04692 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Smarcad1Q04692 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Smarcad1Q04692 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Smarcad1Q04692 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Smarcad1Q04692 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Smarcad1Q04692 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Smarcad1Q04692 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Smarcad1Q04692 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Smarcad1Q04692 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Smarcad1Q04692 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Smarcad1Q04692 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Smarcad1Q04692 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Smarcad1Q04692 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Smarcad1Q04692 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Smarcad1Q04692 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Smarcad1Q04692 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Smarcad1Q04692 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Smarcad1Q04692 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Smarcad1Q04692 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Smarcad1Q04692 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Smarcad1Q04692 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Smarcad1Q04692 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Smarcad1Q04692 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Smarcad1Q04692 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Smarcad1Q04692 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Smarcad1Q04692 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Smarcad1Q04692 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Smarcad1Q04692 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Smarcad1Q04692 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Smarcad1Q04692 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Smarcad1Q04692 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Smarcad1Q04692 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Smarcad1Q04692 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Smarcad1Q04692 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Smarcad1Q04692 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Smarcad1Q04692 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Smarcad1Q04692 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Smarcad1Q04692 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Smarcad1Q04692 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Smarcad1Q04692 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Smarcad1Q04692 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Smarcad1Q04692 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Smarcad1Q04692 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Smarcad1Q04692 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smarcad1Q04692 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smarcad1Q04692 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smarcad1Q04692 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smarcad1Q04692 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smarcad1Q04692 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms