Protein–RNA interactions for Protein: Q04683

Cxcr5, C-X-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr5Q04683 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cxcr5Q04683 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cxcr5Q04683 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cxcr5Q04683 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cxcr5Q04683 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cxcr5Q04683 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cxcr5Q04683 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cxcr5Q04683 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cxcr5Q04683 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cxcr5Q04683 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cxcr5Q04683 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cxcr5Q04683 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cxcr5Q04683 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cxcr5Q04683 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cxcr5Q04683 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cxcr5Q04683 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cxcr5Q04683 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cxcr5Q04683 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cxcr5Q04683 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cxcr5Q04683 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cxcr5Q04683 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cxcr5Q04683 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cxcr5Q04683 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cxcr5Q04683 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cxcr5Q04683 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cxcr5Q04683 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cxcr5Q04683 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cxcr5Q04683 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cxcr5Q04683 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cxcr5Q04683 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cxcr5Q04683 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cxcr5Q04683 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cxcr5Q04683 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cxcr5Q04683 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cxcr5Q04683 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cxcr5Q04683 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Cxcr5Q04683 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cxcr5Q04683 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Cxcr5Q04683 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cxcr5Q04683 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cxcr5Q04683 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cxcr5Q04683 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cxcr5Q04683 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cxcr5Q04683 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cxcr5Q04683 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cxcr5Q04683 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cxcr5Q04683 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cxcr5Q04683 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cxcr5Q04683 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cxcr5Q04683 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cxcr5Q04683 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cxcr5Q04683 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cxcr5Q04683 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cxcr5Q04683 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cxcr5Q04683 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cxcr5Q04683 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cxcr5Q04683 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cxcr5Q04683 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cxcr5Q04683 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cxcr5Q04683 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cxcr5Q04683 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cxcr5Q04683 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cxcr5Q04683 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cxcr5Q04683 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cxcr5Q04683 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cxcr5Q04683 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cxcr5Q04683 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cxcr5Q04683 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cxcr5Q04683 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cxcr5Q04683 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cxcr5Q04683 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cxcr5Q04683 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cxcr5Q04683 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cxcr5Q04683 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cxcr5Q04683 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cxcr5Q04683 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cxcr5Q04683 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cxcr5Q04683 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cxcr5Q04683 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cxcr5Q04683 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cxcr5Q04683 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cxcr5Q04683 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cxcr5Q04683 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cxcr5Q04683 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cxcr5Q04683 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cxcr5Q04683 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cxcr5Q04683 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cxcr5Q04683 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cxcr5Q04683 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cxcr5Q04683 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cxcr5Q04683 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cxcr5Q04683 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cxcr5Q04683 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cxcr5Q04683 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cxcr5Q04683 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cxcr5Q04683 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cxcr5Q04683 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cxcr5Q04683 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cxcr5Q04683 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cxcr5Q04683 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms