Protein–RNA interactions for Protein: Q03146

Ddr1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddr1Q03146 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ddr1Q03146 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ddr1Q03146 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ddr1Q03146 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ddr1Q03146 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ddr1Q03146 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ddr1Q03146 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ddr1Q03146 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ddr1Q03146 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ddr1Q03146 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ddr1Q03146 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ddr1Q03146 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ddr1Q03146 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ddr1Q03146 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ddr1Q03146 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ddr1Q03146 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ddr1Q03146 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ddr1Q03146 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ddr1Q03146 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ddr1Q03146 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ddr1Q03146 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ddr1Q03146 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ddr1Q03146 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ddr1Q03146 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ddr1Q03146 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ddr1Q03146 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ddr1Q03146 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ddr1Q03146 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ddr1Q03146 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ddr1Q03146 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ddr1Q03146 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ddr1Q03146 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ddr1Q03146 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ddr1Q03146 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ddr1Q03146 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ddr1Q03146 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ddr1Q03146 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ddr1Q03146 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ddr1Q03146 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ddr1Q03146 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ddr1Q03146 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ddr1Q03146 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ddr1Q03146 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ddr1Q03146 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ddr1Q03146 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ddr1Q03146 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ddr1Q03146 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ddr1Q03146 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ddr1Q03146 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ddr1Q03146 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ddr1Q03146 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ddr1Q03146 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ddr1Q03146 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ddr1Q03146 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ddr1Q03146 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ddr1Q03146 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ddr1Q03146 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ddr1Q03146 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ddr1Q03146 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ddr1Q03146 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ddr1Q03146 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ddr1Q03146 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Ddr1Q03146 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ddr1Q03146 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ddr1Q03146 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ddr1Q03146 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ddr1Q03146 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ddr1Q03146 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ddr1Q03146 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ddr1Q03146 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ddr1Q03146 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ddr1Q03146 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ddr1Q03146 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ddr1Q03146 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ddr1Q03146 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ddr1Q03146 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ddr1Q03146 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ddr1Q03146 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ddr1Q03146 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ddr1Q03146 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ddr1Q03146 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ddr1Q03146 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ddr1Q03146 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ddr1Q03146 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ddr1Q03146 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ddr1Q03146 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ddr1Q03146 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ddr1Q03146 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ddr1Q03146 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ddr1Q03146 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ddr1Q03146 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ddr1Q03146 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ddr1Q03146 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ddr1Q03146 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ddr1Q03146 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ddr1Q03146 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ddr1Q03146 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ddr1Q03146 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ddr1Q03146 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ddr1Q03146 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms