Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cacna1sQ02789 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cacna1sQ02789 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Cacna1sQ02789 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Cacna1sQ02789 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cacna1sQ02789 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cacna1sQ02789 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cacna1sQ02789 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cacna1sQ02789 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cacna1sQ02789 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cacna1sQ02789 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cacna1sQ02789 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cacna1sQ02789 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cacna1sQ02789 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cacna1sQ02789 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cacna1sQ02789 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cacna1sQ02789 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cacna1sQ02789 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cacna1sQ02789 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cacna1sQ02789 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cacna1sQ02789 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Cacna1sQ02789 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cacna1sQ02789 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cacna1sQ02789 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cacna1sQ02789 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cacna1sQ02789 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cacna1sQ02789 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cacna1sQ02789 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cacna1sQ02789 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Cacna1sQ02789 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cacna1sQ02789 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cacna1sQ02789 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cacna1sQ02789 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cacna1sQ02789 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cacna1sQ02789 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cacna1sQ02789 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cacna1sQ02789 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cacna1sQ02789 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cacna1sQ02789 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cacna1sQ02789 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cacna1sQ02789 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cacna1sQ02789 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cacna1sQ02789 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cacna1sQ02789 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cacna1sQ02789 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Cacna1sQ02789 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cacna1sQ02789 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cacna1sQ02789 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cacna1sQ02789 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cacna1sQ02789 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Cacna1sQ02789 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cacna1sQ02789 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cacna1sQ02789 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cacna1sQ02789 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cacna1sQ02789 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cacna1sQ02789 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cacna1sQ02789 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cacna1sQ02789 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cacna1sQ02789 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cacna1sQ02789 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cacna1sQ02789 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cacna1sQ02789 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cacna1sQ02789 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Cacna1sQ02789 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cacna1sQ02789 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cacna1sQ02789 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cacna1sQ02789 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cacna1sQ02789 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cacna1sQ02789 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cacna1sQ02789 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cacna1sQ02789 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cacna1sQ02789 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cacna1sQ02789 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cacna1sQ02789 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cacna1sQ02789 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cacna1sQ02789 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cacna1sQ02789 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cacna1sQ02789 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cacna1sQ02789 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cacna1sQ02789 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cacna1sQ02789 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cacna1sQ02789 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Cacna1sQ02789 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cacna1sQ02789 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Cacna1sQ02789 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cacna1sQ02789 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cacna1sQ02789 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cacna1sQ02789 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cacna1sQ02789 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Cacna1sQ02789 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cacna1sQ02789 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cacna1sQ02789 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cacna1sQ02789 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cacna1sQ02789 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cacna1sQ02789 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cacna1sQ02789 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cacna1sQ02789 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cacna1sQ02789 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cacna1sQ02789 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cacna1sQ02789 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms