Protein–RNA interactions for Protein: Q02788

Col6a2, Collagen alpha-2(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,034 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a2Q02788 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Col6a2Q02788 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Col6a2Q02788 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Col6a2Q02788 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Col6a2Q02788 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Col6a2Q02788 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Col6a2Q02788 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Col6a2Q02788 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Col6a2Q02788 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Col6a2Q02788 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Col6a2Q02788 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Col6a2Q02788 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Col6a2Q02788 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Col6a2Q02788 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Col6a2Q02788 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Col6a2Q02788 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Col6a2Q02788 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Col6a2Q02788 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Col6a2Q02788 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Col6a2Q02788 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Col6a2Q02788 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Col6a2Q02788 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Col6a2Q02788 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Col6a2Q02788 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Col6a2Q02788 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Col6a2Q02788 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Col6a2Q02788 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Col6a2Q02788 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Col6a2Q02788 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Col6a2Q02788 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Col6a2Q02788 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Col6a2Q02788 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Col6a2Q02788 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Col6a2Q02788 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Col6a2Q02788 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Col6a2Q02788 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Col6a2Q02788 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Col6a2Q02788 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Col6a2Q02788 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Col6a2Q02788 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Col6a2Q02788 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Col6a2Q02788 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Col6a2Q02788 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Col6a2Q02788 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Col6a2Q02788 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Col6a2Q02788 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Col6a2Q02788 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Col6a2Q02788 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Col6a2Q02788 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Col6a2Q02788 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Col6a2Q02788 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Col6a2Q02788 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Col6a2Q02788 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Col6a2Q02788 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Col6a2Q02788 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Col6a2Q02788 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Col6a2Q02788 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Col6a2Q02788 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Col6a2Q02788 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Col6a2Q02788 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Col6a2Q02788 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Col6a2Q02788 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Col6a2Q02788 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Col6a2Q02788 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Col6a2Q02788 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Col6a2Q02788 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Col6a2Q02788 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Col6a2Q02788 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Col6a2Q02788 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Col6a2Q02788 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Col6a2Q02788 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Col6a2Q02788 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Col6a2Q02788 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Col6a2Q02788 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Col6a2Q02788 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Col6a2Q02788 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Col6a2Q02788 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Col6a2Q02788 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Col6a2Q02788 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Col6a2Q02788 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Col6a2Q02788 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Col6a2Q02788 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Col6a2Q02788 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Col6a2Q02788 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Col6a2Q02788 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Col6a2Q02788 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Col6a2Q02788 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Col6a2Q02788 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Col6a2Q02788 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Col6a2Q02788 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Col6a2Q02788 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Col6a2Q02788 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Col6a2Q02788 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Col6a2Q02788 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Col6a2Q02788 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Col6a2Q02788 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Col6a2Q02788 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Col6a2Q02788 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Col6a2Q02788 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Col6a2Q02788 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms