Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NfiaQ02780 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NfiaQ02780 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NfiaQ02780 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NfiaQ02780 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NfiaQ02780 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NfiaQ02780 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NfiaQ02780 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NfiaQ02780 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NfiaQ02780 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NfiaQ02780 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NfiaQ02780 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NfiaQ02780 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NfiaQ02780 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
NfiaQ02780 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
NfiaQ02780 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NfiaQ02780 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NfiaQ02780 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NfiaQ02780 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NfiaQ02780 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NfiaQ02780 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NfiaQ02780 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NfiaQ02780 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NfiaQ02780 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NfiaQ02780 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NfiaQ02780 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NfiaQ02780 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
NfiaQ02780 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NfiaQ02780 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NfiaQ02780 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NfiaQ02780 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NfiaQ02780 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NfiaQ02780 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NfiaQ02780 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NfiaQ02780 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NfiaQ02780 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NfiaQ02780 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NfiaQ02780 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NfiaQ02780 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NfiaQ02780 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NfiaQ02780 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NfiaQ02780 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NfiaQ02780 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NfiaQ02780 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
NfiaQ02780 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NfiaQ02780 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NfiaQ02780 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NfiaQ02780 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
NfiaQ02780 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NfiaQ02780 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NfiaQ02780 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NfiaQ02780 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NfiaQ02780 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NfiaQ02780 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NfiaQ02780 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NfiaQ02780 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NfiaQ02780 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
NfiaQ02780 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NfiaQ02780 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NfiaQ02780 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NfiaQ02780 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
NfiaQ02780 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NfiaQ02780 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NfiaQ02780 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NfiaQ02780 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NfiaQ02780 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NfiaQ02780 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NfiaQ02780 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NfiaQ02780 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NfiaQ02780 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NfiaQ02780 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NfiaQ02780 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NfiaQ02780 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NfiaQ02780 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
NfiaQ02780 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NfiaQ02780 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NfiaQ02780 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NfiaQ02780 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NfiaQ02780 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NfiaQ02780 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NfiaQ02780 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NfiaQ02780 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NfiaQ02780 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NfiaQ02780 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
NfiaQ02780 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
NfiaQ02780 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NfiaQ02780 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NfiaQ02780 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NfiaQ02780 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NfiaQ02780 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NfiaQ02780 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NfiaQ02780 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NfiaQ02780 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NfiaQ02780 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NfiaQ02780 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NfiaQ02780 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NfiaQ02780 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NfiaQ02780 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NfiaQ02780 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NfiaQ02780 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms