Protein–RNA interactions for Protein: Q02739

Gjb5, Gap junction beta-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb5Q02739 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gjb5Q02739 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gjb5Q02739 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gjb5Q02739 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gjb5Q02739 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gjb5Q02739 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gjb5Q02739 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gjb5Q02739 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gjb5Q02739 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gjb5Q02739 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gjb5Q02739 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gjb5Q02739 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gjb5Q02739 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gjb5Q02739 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gjb5Q02739 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gjb5Q02739 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gjb5Q02739 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Gjb5Q02739 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gjb5Q02739 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gjb5Q02739 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gjb5Q02739 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gjb5Q02739 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gjb5Q02739 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gjb5Q02739 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gjb5Q02739 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gjb5Q02739 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gjb5Q02739 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gjb5Q02739 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gjb5Q02739 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gjb5Q02739 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gjb5Q02739 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gjb5Q02739 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gjb5Q02739 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gjb5Q02739 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gjb5Q02739 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gjb5Q02739 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gjb5Q02739 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gjb5Q02739 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gjb5Q02739 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gjb5Q02739 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Gjb5Q02739 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gjb5Q02739 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gjb5Q02739 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gjb5Q02739 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gjb5Q02739 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gjb5Q02739 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gjb5Q02739 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gjb5Q02739 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gjb5Q02739 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gjb5Q02739 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gjb5Q02739 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Gjb5Q02739 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gjb5Q02739 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gjb5Q02739 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gjb5Q02739 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gjb5Q02739 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gjb5Q02739 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gjb5Q02739 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gjb5Q02739 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gjb5Q02739 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gjb5Q02739 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gjb5Q02739 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gjb5Q02739 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gjb5Q02739 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gjb5Q02739 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gjb5Q02739 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gjb5Q02739 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gjb5Q02739 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Gjb5Q02739 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gjb5Q02739 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gjb5Q02739 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gjb5Q02739 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gjb5Q02739 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gjb5Q02739 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gjb5Q02739 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gjb5Q02739 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gjb5Q02739 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gjb5Q02739 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gjb5Q02739 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gjb5Q02739 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gjb5Q02739 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gjb5Q02739 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gjb5Q02739 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gjb5Q02739 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gjb5Q02739 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gjb5Q02739 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gjb5Q02739 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gjb5Q02739 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gjb5Q02739 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gjb5Q02739 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gjb5Q02739 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gjb5Q02739 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gjb5Q02739 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gjb5Q02739 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gjb5Q02739 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gjb5Q02739 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gjb5Q02739 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Gjb5Q02739 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gjb5Q02739 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gjb5Q02739 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms