Protein–RNA interactions for Protein: Q02576

Nhlh1, Helix-loop-helix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlh1Q02576 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nhlh1Q02576 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nhlh1Q02576 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nhlh1Q02576 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Nhlh1Q02576 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nhlh1Q02576 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Nhlh1Q02576 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nhlh1Q02576 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nhlh1Q02576 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nhlh1Q02576 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nhlh1Q02576 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nhlh1Q02576 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nhlh1Q02576 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nhlh1Q02576 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nhlh1Q02576 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nhlh1Q02576 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nhlh1Q02576 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nhlh1Q02576 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nhlh1Q02576 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nhlh1Q02576 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nhlh1Q02576 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nhlh1Q02576 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nhlh1Q02576 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Nhlh1Q02576 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nhlh1Q02576 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nhlh1Q02576 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nhlh1Q02576 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nhlh1Q02576 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nhlh1Q02576 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nhlh1Q02576 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nhlh1Q02576 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nhlh1Q02576 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nhlh1Q02576 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nhlh1Q02576 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nhlh1Q02576 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nhlh1Q02576 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nhlh1Q02576 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nhlh1Q02576 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nhlh1Q02576 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nhlh1Q02576 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Nhlh1Q02576 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nhlh1Q02576 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nhlh1Q02576 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Nhlh1Q02576 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nhlh1Q02576 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nhlh1Q02576 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Nhlh1Q02576 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nhlh1Q02576 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nhlh1Q02576 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nhlh1Q02576 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nhlh1Q02576 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nhlh1Q02576 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nhlh1Q02576 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nhlh1Q02576 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nhlh1Q02576 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nhlh1Q02576 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Nhlh1Q02576 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nhlh1Q02576 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nhlh1Q02576 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nhlh1Q02576 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nhlh1Q02576 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nhlh1Q02576 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nhlh1Q02576 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nhlh1Q02576 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nhlh1Q02576 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Nhlh1Q02576 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nhlh1Q02576 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nhlh1Q02576 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nhlh1Q02576 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nhlh1Q02576 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nhlh1Q02576 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nhlh1Q02576 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nhlh1Q02576 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nhlh1Q02576 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nhlh1Q02576 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Nhlh1Q02576 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nhlh1Q02576 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nhlh1Q02576 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nhlh1Q02576 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nhlh1Q02576 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nhlh1Q02576 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Nhlh1Q02576 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nhlh1Q02576 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nhlh1Q02576 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nhlh1Q02576 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nhlh1Q02576 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nhlh1Q02576 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nhlh1Q02576 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nhlh1Q02576 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nhlh1Q02576 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nhlh1Q02576 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nhlh1Q02576 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nhlh1Q02576 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Nhlh1Q02576 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nhlh1Q02576 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nhlh1Q02576 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nhlh1Q02576 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nhlh1Q02576 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nhlh1Q02576 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nhlh1Q02576 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms