Protein–RNA interactions for Protein: Q02526

Zfp41, Zinc finger protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp41Q02526 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp41Q02526 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp41Q02526 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp41Q02526 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp41Q02526 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp41Q02526 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp41Q02526 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp41Q02526 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp41Q02526 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp41Q02526 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp41Q02526 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp41Q02526 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp41Q02526 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp41Q02526 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp41Q02526 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp41Q02526 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp41Q02526 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp41Q02526 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp41Q02526 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp41Q02526 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp41Q02526 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp41Q02526 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp41Q02526 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp41Q02526 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp41Q02526 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp41Q02526 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp41Q02526 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp41Q02526 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp41Q02526 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Zfp41Q02526 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp41Q02526 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp41Q02526 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp41Q02526 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp41Q02526 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp41Q02526 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp41Q02526 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp41Q02526 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp41Q02526 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp41Q02526 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp41Q02526 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp41Q02526 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp41Q02526 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp41Q02526 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp41Q02526 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp41Q02526 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp41Q02526 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp41Q02526 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp41Q02526 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp41Q02526 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp41Q02526 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp41Q02526 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp41Q02526 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp41Q02526 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp41Q02526 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp41Q02526 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp41Q02526 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp41Q02526 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp41Q02526 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp41Q02526 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp41Q02526 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp41Q02526 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp41Q02526 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp41Q02526 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp41Q02526 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp41Q02526 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp41Q02526 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp41Q02526 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp41Q02526 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp41Q02526 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp41Q02526 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp41Q02526 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp41Q02526 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp41Q02526 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp41Q02526 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp41Q02526 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp41Q02526 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp41Q02526 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp41Q02526 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp41Q02526 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp41Q02526 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp41Q02526 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp41Q02526 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp41Q02526 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp41Q02526 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp41Q02526 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp41Q02526 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp41Q02526 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp41Q02526 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp41Q02526 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp41Q02526 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp41Q02526 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp41Q02526 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp41Q02526 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp41Q02526 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp41Q02526 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp41Q02526 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp41Q02526 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp41Q02526 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp41Q02526 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp41Q02526 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms