Protein–RNA interactions for Protein: Q02248

Ctnnb1, Catenin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnb1Q02248 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctnnb1Q02248 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctnnb1Q02248 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctnnb1Q02248 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctnnb1Q02248 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctnnb1Q02248 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctnnb1Q02248 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctnnb1Q02248 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctnnb1Q02248 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctnnb1Q02248 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctnnb1Q02248 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctnnb1Q02248 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctnnb1Q02248 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctnnb1Q02248 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctnnb1Q02248 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctnnb1Q02248 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctnnb1Q02248 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctnnb1Q02248 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctnnb1Q02248 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctnnb1Q02248 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctnnb1Q02248 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctnnb1Q02248 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctnnb1Q02248 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctnnb1Q02248 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctnnb1Q02248 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctnnb1Q02248 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctnnb1Q02248 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctnnb1Q02248 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctnnb1Q02248 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctnnb1Q02248 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctnnb1Q02248 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctnnb1Q02248 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctnnb1Q02248 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctnnb1Q02248 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctnnb1Q02248 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctnnb1Q02248 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctnnb1Q02248 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctnnb1Q02248 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctnnb1Q02248 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctnnb1Q02248 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctnnb1Q02248 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctnnb1Q02248 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctnnb1Q02248 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctnnb1Q02248 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctnnb1Q02248 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctnnb1Q02248 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctnnb1Q02248 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctnnb1Q02248 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctnnb1Q02248 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctnnb1Q02248 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctnnb1Q02248 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctnnb1Q02248 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctnnb1Q02248 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctnnb1Q02248 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctnnb1Q02248 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctnnb1Q02248 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ctnnb1Q02248 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ctnnb1Q02248 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ctnnb1Q02248 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ctnnb1Q02248 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Ctnnb1Q02248 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ctnnb1Q02248 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ctnnb1Q02248 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Ctnnb1Q02248 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Ctnnb1Q02248 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ctnnb1Q02248 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Ctnnb1Q02248 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ctnnb1Q02248 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ctnnb1Q02248 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ctnnb1Q02248 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Ctnnb1Q02248 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ctnnb1Q02248 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ctnnb1Q02248 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ctnnb1Q02248 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ctnnb1Q02248 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctnnb1Q02248 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctnnb1Q02248 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctnnb1Q02248 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctnnb1Q02248 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctnnb1Q02248 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctnnb1Q02248 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctnnb1Q02248 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctnnb1Q02248 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctnnb1Q02248 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctnnb1Q02248 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctnnb1Q02248 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctnnb1Q02248 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctnnb1Q02248 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctnnb1Q02248 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctnnb1Q02248 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctnnb1Q02248 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctnnb1Q02248 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctnnb1Q02248 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctnnb1Q02248 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctnnb1Q02248 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctnnb1Q02248 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctnnb1Q02248 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctnnb1Q02248 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctnnb1Q02248 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctnnb1Q02248 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms