Protein–RNA interactions for Protein: Q02242

Pdcd1, Programmed cell death protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd1Q02242 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdcd1Q02242 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdcd1Q02242 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdcd1Q02242 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdcd1Q02242 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdcd1Q02242 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdcd1Q02242 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdcd1Q02242 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdcd1Q02242 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdcd1Q02242 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdcd1Q02242 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdcd1Q02242 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdcd1Q02242 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdcd1Q02242 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdcd1Q02242 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdcd1Q02242 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdcd1Q02242 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdcd1Q02242 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdcd1Q02242 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdcd1Q02242 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdcd1Q02242 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdcd1Q02242 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdcd1Q02242 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdcd1Q02242 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdcd1Q02242 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdcd1Q02242 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdcd1Q02242 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdcd1Q02242 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdcd1Q02242 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdcd1Q02242 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdcd1Q02242 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdcd1Q02242 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdcd1Q02242 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdcd1Q02242 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdcd1Q02242 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdcd1Q02242 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdcd1Q02242 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdcd1Q02242 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdcd1Q02242 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdcd1Q02242 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdcd1Q02242 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdcd1Q02242 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdcd1Q02242 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdcd1Q02242 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdcd1Q02242 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdcd1Q02242 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdcd1Q02242 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdcd1Q02242 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdcd1Q02242 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdcd1Q02242 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdcd1Q02242 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdcd1Q02242 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdcd1Q02242 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdcd1Q02242 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdcd1Q02242 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdcd1Q02242 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdcd1Q02242 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdcd1Q02242 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdcd1Q02242 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdcd1Q02242 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdcd1Q02242 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Pdcd1Q02242 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pdcd1Q02242 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pdcd1Q02242 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pdcd1Q02242 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Pdcd1Q02242 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Pdcd1Q02242 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pdcd1Q02242 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pdcd1Q02242 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pdcd1Q02242 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pdcd1Q02242 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pdcd1Q02242 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pdcd1Q02242 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pdcd1Q02242 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pdcd1Q02242 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pdcd1Q02242 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pdcd1Q02242 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pdcd1Q02242 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pdcd1Q02242 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pdcd1Q02242 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pdcd1Q02242 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pdcd1Q02242 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pdcd1Q02242 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pdcd1Q02242 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pdcd1Q02242 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Pdcd1Q02242 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pdcd1Q02242 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pdcd1Q02242 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pdcd1Q02242 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pdcd1Q02242 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pdcd1Q02242 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Pdcd1Q02242 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pdcd1Q02242 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pdcd1Q02242 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pdcd1Q02242 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pdcd1Q02242 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pdcd1Q02242 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pdcd1Q02242 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pdcd1Q02242 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pdcd1Q02242 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms