Protein–RNA interactions for Protein: Q02085

Snai1, Zinc finger protein SNAI1, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai1Q02085 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Snai1Q02085 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Snai1Q02085 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Snai1Q02085 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Snai1Q02085 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Snai1Q02085 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Snai1Q02085 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Snai1Q02085 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Snai1Q02085 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Snai1Q02085 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Snai1Q02085 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Snai1Q02085 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Snai1Q02085 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Snai1Q02085 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Snai1Q02085 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Snai1Q02085 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Snai1Q02085 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Snai1Q02085 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Snai1Q02085 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Snai1Q02085 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Snai1Q02085 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Snai1Q02085 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Snai1Q02085 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Snai1Q02085 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Snai1Q02085 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Snai1Q02085 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Snai1Q02085 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Snai1Q02085 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Snai1Q02085 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Snai1Q02085 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Snai1Q02085 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Snai1Q02085 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Snai1Q02085 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Snai1Q02085 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Snai1Q02085 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Snai1Q02085 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Snai1Q02085 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Snai1Q02085 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Snai1Q02085 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Snai1Q02085 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Snai1Q02085 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Snai1Q02085 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Snai1Q02085 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Snai1Q02085 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Snai1Q02085 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snai1Q02085 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snai1Q02085 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snai1Q02085 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snai1Q02085 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snai1Q02085 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Snai1Q02085 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snai1Q02085 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Snai1Q02085 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snai1Q02085 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snai1Q02085 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snai1Q02085 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snai1Q02085 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snai1Q02085 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snai1Q02085 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snai1Q02085 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snai1Q02085 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snai1Q02085 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snai1Q02085 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Snai1Q02085 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Snai1Q02085 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Snai1Q02085 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Snai1Q02085 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Snai1Q02085 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Snai1Q02085 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Snai1Q02085 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Snai1Q02085 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Snai1Q02085 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Snai1Q02085 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Snai1Q02085 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Snai1Q02085 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Snai1Q02085 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Snai1Q02085 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Snai1Q02085 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Snai1Q02085 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Snai1Q02085 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Snai1Q02085 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Snai1Q02085 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Snai1Q02085 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Snai1Q02085 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Snai1Q02085 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Snai1Q02085 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Snai1Q02085 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Snai1Q02085 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Snai1Q02085 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Snai1Q02085 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Snai1Q02085 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Snai1Q02085 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Snai1Q02085 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Snai1Q02085 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Snai1Q02085 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Snai1Q02085 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Snai1Q02085 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Snai1Q02085 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Snai1Q02085 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snai1Q02085 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.5 ms