Protein–RNA interactions for Protein: Q02067

Ascl1, Achaete-scute homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl1Q02067 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ascl1Q02067 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ascl1Q02067 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ascl1Q02067 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ascl1Q02067 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ascl1Q02067 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ascl1Q02067 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ascl1Q02067 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ascl1Q02067 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ascl1Q02067 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ascl1Q02067 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ascl1Q02067 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ascl1Q02067 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ascl1Q02067 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ascl1Q02067 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ascl1Q02067 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ascl1Q02067 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ascl1Q02067 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ascl1Q02067 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ascl1Q02067 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ascl1Q02067 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ascl1Q02067 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ascl1Q02067 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ascl1Q02067 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ascl1Q02067 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ascl1Q02067 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ascl1Q02067 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ascl1Q02067 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ascl1Q02067 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ascl1Q02067 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ascl1Q02067 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ascl1Q02067 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ascl1Q02067 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ascl1Q02067 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ascl1Q02067 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ascl1Q02067 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ascl1Q02067 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ascl1Q02067 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ascl1Q02067 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ascl1Q02067 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ascl1Q02067 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ascl1Q02067 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ascl1Q02067 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ascl1Q02067 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ascl1Q02067 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ascl1Q02067 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ascl1Q02067 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ascl1Q02067 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ascl1Q02067 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ascl1Q02067 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ascl1Q02067 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ascl1Q02067 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ascl1Q02067 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ascl1Q02067 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ascl1Q02067 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ascl1Q02067 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ascl1Q02067 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ascl1Q02067 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ascl1Q02067 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ascl1Q02067 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ascl1Q02067 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ascl1Q02067 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ascl1Q02067 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ascl1Q02067 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ascl1Q02067 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ascl1Q02067 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ascl1Q02067 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ascl1Q02067 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ascl1Q02067 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ascl1Q02067 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ascl1Q02067 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ascl1Q02067 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ascl1Q02067 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ascl1Q02067 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ascl1Q02067 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ascl1Q02067 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ascl1Q02067 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ascl1Q02067 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ascl1Q02067 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ascl1Q02067 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ascl1Q02067 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ascl1Q02067 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ascl1Q02067 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ascl1Q02067 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ascl1Q02067 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ascl1Q02067 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ascl1Q02067 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ascl1Q02067 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ascl1Q02067 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ascl1Q02067 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ascl1Q02067 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ascl1Q02067 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ascl1Q02067 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ascl1Q02067 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ascl1Q02067 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ascl1Q02067 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ascl1Q02067 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ascl1Q02067 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Ascl1Q02067 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ascl1Q02067 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms