Protein–RNA interactions for Protein: Q01887

Ryk, Tyrosine-protein kinase RYK, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RykQ01887 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RykQ01887 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RykQ01887 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RykQ01887 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RykQ01887 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RykQ01887 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RykQ01887 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RykQ01887 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RykQ01887 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RykQ01887 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RykQ01887 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RykQ01887 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RykQ01887 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RykQ01887 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RykQ01887 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RykQ01887 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RykQ01887 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RykQ01887 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RykQ01887 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RykQ01887 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RykQ01887 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RykQ01887 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RykQ01887 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RykQ01887 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RykQ01887 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RykQ01887 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RykQ01887 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RykQ01887 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RykQ01887 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RykQ01887 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RykQ01887 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RykQ01887 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RykQ01887 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RykQ01887 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RykQ01887 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RykQ01887 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RykQ01887 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RykQ01887 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RykQ01887 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RykQ01887 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RykQ01887 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RykQ01887 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RykQ01887 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RykQ01887 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RykQ01887 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RykQ01887 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RykQ01887 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RykQ01887 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RykQ01887 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RykQ01887 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RykQ01887 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RykQ01887 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RykQ01887 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RykQ01887 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RykQ01887 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RykQ01887 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RykQ01887 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RykQ01887 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RykQ01887 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RykQ01887 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RykQ01887 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RykQ01887 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RykQ01887 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RykQ01887 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RykQ01887 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RykQ01887 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RykQ01887 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RykQ01887 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RykQ01887 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RykQ01887 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RykQ01887 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RykQ01887 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RykQ01887 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RykQ01887 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RykQ01887 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RykQ01887 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RykQ01887 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RykQ01887 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RykQ01887 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RykQ01887 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RykQ01887 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RykQ01887 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RykQ01887 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RykQ01887 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RykQ01887 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RykQ01887 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RykQ01887 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RykQ01887 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RykQ01887 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RykQ01887 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RykQ01887 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RykQ01887 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RykQ01887 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RykQ01887 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RykQ01887 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RykQ01887 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RykQ01887 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RykQ01887 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RykQ01887 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RykQ01887 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.3 ms