Protein–RNA interactions for Protein: Q01768

Nme2, Nucleoside diphosphate kinase B, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme2Q01768 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nme2Q01768 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nme2Q01768 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nme2Q01768 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Nme2Q01768 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Nme2Q01768 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nme2Q01768 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nme2Q01768 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nme2Q01768 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nme2Q01768 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nme2Q01768 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nme2Q01768 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nme2Q01768 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nme2Q01768 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nme2Q01768 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nme2Q01768 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Nme2Q01768 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nme2Q01768 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nme2Q01768 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nme2Q01768 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nme2Q01768 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nme2Q01768 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nme2Q01768 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nme2Q01768 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nme2Q01768 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nme2Q01768 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nme2Q01768 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nme2Q01768 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nme2Q01768 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Nme2Q01768 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Nme2Q01768 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nme2Q01768 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nme2Q01768 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nme2Q01768 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nme2Q01768 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nme2Q01768 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nme2Q01768 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Nme2Q01768 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nme2Q01768 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nme2Q01768 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nme2Q01768 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nme2Q01768 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nme2Q01768 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nme2Q01768 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nme2Q01768 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nme2Q01768 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nme2Q01768 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nme2Q01768 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nme2Q01768 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nme2Q01768 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nme2Q01768 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nme2Q01768 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nme2Q01768 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nme2Q01768 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nme2Q01768 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nme2Q01768 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nme2Q01768 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Nme2Q01768 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nme2Q01768 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nme2Q01768 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nme2Q01768 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nme2Q01768 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nme2Q01768 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nme2Q01768 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nme2Q01768 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nme2Q01768 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nme2Q01768 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nme2Q01768 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nme2Q01768 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nme2Q01768 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nme2Q01768 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nme2Q01768 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nme2Q01768 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nme2Q01768 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nme2Q01768 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nme2Q01768 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Nme2Q01768 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nme2Q01768 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nme2Q01768 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nme2Q01768 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nme2Q01768 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nme2Q01768 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nme2Q01768 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nme2Q01768 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nme2Q01768 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nme2Q01768 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nme2Q01768 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nme2Q01768 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Nme2Q01768 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nme2Q01768 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nme2Q01768 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nme2Q01768 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nme2Q01768 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nme2Q01768 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nme2Q01768 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nme2Q01768 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nme2Q01768 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nme2Q01768 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nme2Q01768 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nme2Q01768 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms