Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mc1rQ01727 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mc1rQ01727 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mc1rQ01727 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mc1rQ01727 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mc1rQ01727 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mc1rQ01727 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mc1rQ01727 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mc1rQ01727 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mc1rQ01727 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Mc1rQ01727 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Mc1rQ01727 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mc1rQ01727 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mc1rQ01727 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mc1rQ01727 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mc1rQ01727 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mc1rQ01727 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mc1rQ01727 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mc1rQ01727 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mc1rQ01727 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mc1rQ01727 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mc1rQ01727 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mc1rQ01727 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Mc1rQ01727 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Mc1rQ01727 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mc1rQ01727 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mc1rQ01727 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mc1rQ01727 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mc1rQ01727 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mc1rQ01727 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Mc1rQ01727 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mc1rQ01727 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mc1rQ01727 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mc1rQ01727 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mc1rQ01727 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mc1rQ01727 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mc1rQ01727 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mc1rQ01727 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mc1rQ01727 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mc1rQ01727 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mc1rQ01727 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mc1rQ01727 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mc1rQ01727 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Mc1rQ01727 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Mc1rQ01727 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mc1rQ01727 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mc1rQ01727 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Mc1rQ01727 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mc1rQ01727 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mc1rQ01727 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mc1rQ01727 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mc1rQ01727 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Mc1rQ01727 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mc1rQ01727 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mc1rQ01727 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mc1rQ01727 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mc1rQ01727 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mc1rQ01727 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mc1rQ01727 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mc1rQ01727 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mc1rQ01727 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mc1rQ01727 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mc1rQ01727 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mc1rQ01727 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mc1rQ01727 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mc1rQ01727 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mc1rQ01727 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mc1rQ01727 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mc1rQ01727 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mc1rQ01727 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mc1rQ01727 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mc1rQ01727 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mc1rQ01727 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mc1rQ01727 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mc1rQ01727 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mc1rQ01727 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mc1rQ01727 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mc1rQ01727 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mc1rQ01727 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mc1rQ01727 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mc1rQ01727 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mc1rQ01727 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mc1rQ01727 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mc1rQ01727 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mc1rQ01727 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mc1rQ01727 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mc1rQ01727 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mc1rQ01727 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mc1rQ01727 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mc1rQ01727 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Mc1rQ01727 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mc1rQ01727 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mc1rQ01727 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mc1rQ01727 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mc1rQ01727 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mc1rQ01727 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mc1rQ01727 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mc1rQ01727 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mc1rQ01727 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mc1rQ01727 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms