Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
EgfrQ01279 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EgfrQ01279 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EgfrQ01279 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.27■■□□□ 1
EgfrQ01279 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
EgfrQ01279 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EgfrQ01279 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EgfrQ01279 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EgfrQ01279 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
EgfrQ01279 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
EgfrQ01279 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EgfrQ01279 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EgfrQ01279 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
EgfrQ01279 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
EgfrQ01279 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EgfrQ01279 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EgfrQ01279 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EgfrQ01279 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EgfrQ01279 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EgfrQ01279 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EgfrQ01279 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EgfrQ01279 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EgfrQ01279 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EgfrQ01279 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EgfrQ01279 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
EgfrQ01279 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
EgfrQ01279 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EgfrQ01279 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EgfrQ01279 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EgfrQ01279 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EgfrQ01279 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EgfrQ01279 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EgfrQ01279 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EgfrQ01279 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EgfrQ01279 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EgfrQ01279 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EgfrQ01279 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EgfrQ01279 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EgfrQ01279 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EgfrQ01279 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
EgfrQ01279 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EgfrQ01279 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EgfrQ01279 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EgfrQ01279 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EgfrQ01279 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EgfrQ01279 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
EgfrQ01279 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EgfrQ01279 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EgfrQ01279 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EgfrQ01279 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
EgfrQ01279 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EgfrQ01279 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EgfrQ01279 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EgfrQ01279 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
EgfrQ01279 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EgfrQ01279 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EgfrQ01279 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EgfrQ01279 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EgfrQ01279 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EgfrQ01279 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EgfrQ01279 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EgfrQ01279 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EgfrQ01279 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EgfrQ01279 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EgfrQ01279 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EgfrQ01279 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EgfrQ01279 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EgfrQ01279 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EgfrQ01279 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EgfrQ01279 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EgfrQ01279 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EgfrQ01279 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EgfrQ01279 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
EgfrQ01279 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EgfrQ01279 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EgfrQ01279 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EgfrQ01279 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EgfrQ01279 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EgfrQ01279 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
EgfrQ01279 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EgfrQ01279 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EgfrQ01279 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
EgfrQ01279 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EgfrQ01279 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EgfrQ01279 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EgfrQ01279 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EgfrQ01279 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EgfrQ01279 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EgfrQ01279 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EgfrQ01279 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EgfrQ01279 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EgfrQ01279 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EgfrQ01279 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
EgfrQ01279 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EgfrQ01279 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EgfrQ01279 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EgfrQ01279 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EgfrQ01279 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
EgfrQ01279 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EgfrQ01279 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms