Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Grin2bQ01097 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Grin2bQ01097 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Grin2bQ01097 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Grin2bQ01097 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Grin2bQ01097 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Grin2bQ01097 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Grin2bQ01097 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Grin2bQ01097 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Grin2bQ01097 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Grin2bQ01097 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Grin2bQ01097 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Grin2bQ01097 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Grin2bQ01097 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Grin2bQ01097 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Grin2bQ01097 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Grin2bQ01097 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Grin2bQ01097 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Grin2bQ01097 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Grin2bQ01097 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Grin2bQ01097 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Grin2bQ01097 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Grin2bQ01097 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Grin2bQ01097 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Grin2bQ01097 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Grin2bQ01097 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Grin2bQ01097 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Grin2bQ01097 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Grin2bQ01097 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Grin2bQ01097 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Grin2bQ01097 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Grin2bQ01097 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Grin2bQ01097 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Grin2bQ01097 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Grin2bQ01097 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Grin2bQ01097 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Grin2bQ01097 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Grin2bQ01097 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Grin2bQ01097 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Grin2bQ01097 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Grin2bQ01097 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Grin2bQ01097 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Grin2bQ01097 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Grin2bQ01097 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Grin2bQ01097 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Grin2bQ01097 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Grin2bQ01097 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Grin2bQ01097 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Grin2bQ01097 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Grin2bQ01097 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Grin2bQ01097 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
Grin2bQ01097 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Grin2bQ01097 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Grin2bQ01097 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Grin2bQ01097 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Grin2bQ01097 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Grin2bQ01097 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Grin2bQ01097 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Grin2bQ01097 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Grin2bQ01097 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Grin2bQ01097 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Grin2bQ01097 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Grin2bQ01097 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Grin2bQ01097 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Grin2bQ01097 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Grin2bQ01097 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Grin2bQ01097 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Grin2bQ01097 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Grin2bQ01097 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Grin2bQ01097 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Grin2bQ01097 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Grin2bQ01097 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Grin2bQ01097 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Grin2bQ01097 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Grin2bQ01097 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Grin2bQ01097 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Grin2bQ01097 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Grin2bQ01097 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Grin2bQ01097 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Grin2bQ01097 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Grin2bQ01097 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Grin2bQ01097 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Grin2bQ01097 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Grin2bQ01097 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Grin2bQ01097 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Grin2bQ01097 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Grin2bQ01097 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Grin2bQ01097 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Grin2bQ01097 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Grin2bQ01097 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Grin2bQ01097 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Grin2bQ01097 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Grin2bQ01097 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Grin2bQ01097 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Grin2bQ01097 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Grin2bQ01097 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Grin2bQ01097 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Grin2bQ01097 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Grin2bQ01097 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Grin2bQ01097 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms