Protein–RNA interactions for Protein: Q00262

Stx2, Syntaxin-2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx2Q00262 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Stx2Q00262 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Stx2Q00262 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Stx2Q00262 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Stx2Q00262 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Stx2Q00262 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Stx2Q00262 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Stx2Q00262 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Stx2Q00262 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Stx2Q00262 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Stx2Q00262 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Stx2Q00262 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Stx2Q00262 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Stx2Q00262 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Stx2Q00262 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Stx2Q00262 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Stx2Q00262 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Stx2Q00262 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Stx2Q00262 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Stx2Q00262 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Stx2Q00262 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Stx2Q00262 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Stx2Q00262 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Stx2Q00262 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Stx2Q00262 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Stx2Q00262 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Stx2Q00262 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Stx2Q00262 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Stx2Q00262 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Stx2Q00262 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Stx2Q00262 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Stx2Q00262 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Stx2Q00262 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Stx2Q00262 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Stx2Q00262 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Stx2Q00262 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Stx2Q00262 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Stx2Q00262 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Stx2Q00262 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Stx2Q00262 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Stx2Q00262 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Stx2Q00262 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Stx2Q00262 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Stx2Q00262 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Stx2Q00262 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Stx2Q00262 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Stx2Q00262 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Stx2Q00262 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Stx2Q00262 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Stx2Q00262 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Stx2Q00262 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Stx2Q00262 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Stx2Q00262 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Stx2Q00262 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Stx2Q00262 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Stx2Q00262 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Stx2Q00262 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Stx2Q00262 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Stx2Q00262 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Stx2Q00262 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Stx2Q00262 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Stx2Q00262 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Stx2Q00262 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Stx2Q00262 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Stx2Q00262 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Stx2Q00262 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Stx2Q00262 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Stx2Q00262 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Stx2Q00262 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Stx2Q00262 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Stx2Q00262 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Stx2Q00262 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Stx2Q00262 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Stx2Q00262 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Stx2Q00262 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Stx2Q00262 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Stx2Q00262 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Stx2Q00262 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Stx2Q00262 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Stx2Q00262 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Stx2Q00262 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Stx2Q00262 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Stx2Q00262 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Stx2Q00262 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Stx2Q00262 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Stx2Q00262 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Stx2Q00262 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Stx2Q00262 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Stx2Q00262 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Stx2Q00262 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Stx2Q00262 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Stx2Q00262 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Stx2Q00262 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Stx2Q00262 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Stx2Q00262 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Stx2Q00262 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Stx2Q00262 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Stx2Q00262 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Stx2Q00262 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Stx2Q00262 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms