Protein–RNA interactions for Protein: P97793

Alk, ALK tyrosine kinase receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlkP97793 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
AlkP97793 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
AlkP97793 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
AlkP97793 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
AlkP97793 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
AlkP97793 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
AlkP97793 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
AlkP97793 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
AlkP97793 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
AlkP97793 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
AlkP97793 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
AlkP97793 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
AlkP97793 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
AlkP97793 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
AlkP97793 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
AlkP97793 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
AlkP97793 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
AlkP97793 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
AlkP97793 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
AlkP97793 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
AlkP97793 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
AlkP97793 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
AlkP97793 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
AlkP97793 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
AlkP97793 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
AlkP97793 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
AlkP97793 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
AlkP97793 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
AlkP97793 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
AlkP97793 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
AlkP97793 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
AlkP97793 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
AlkP97793 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
AlkP97793 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
AlkP97793 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
AlkP97793 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
AlkP97793 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
AlkP97793 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
AlkP97793 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
AlkP97793 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
AlkP97793 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
AlkP97793 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
AlkP97793 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
AlkP97793 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
AlkP97793 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
AlkP97793 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
AlkP97793 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
AlkP97793 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
AlkP97793 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
AlkP97793 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
AlkP97793 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
AlkP97793 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
AlkP97793 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
AlkP97793 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
AlkP97793 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
AlkP97793 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
AlkP97793 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
AlkP97793 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
AlkP97793 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
AlkP97793 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
AlkP97793 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
AlkP97793 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
AlkP97793 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
AlkP97793 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
AlkP97793 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
AlkP97793 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
AlkP97793 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
AlkP97793 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
AlkP97793 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
AlkP97793 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
AlkP97793 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
AlkP97793 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
AlkP97793 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
AlkP97793 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
AlkP97793 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
AlkP97793 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
AlkP97793 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
AlkP97793 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
AlkP97793 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
AlkP97793 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
AlkP97793 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
AlkP97793 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
AlkP97793 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
AlkP97793 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
AlkP97793 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
AlkP97793 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
AlkP97793 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
AlkP97793 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
AlkP97793 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
AlkP97793 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
AlkP97793 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
AlkP97793 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
AlkP97793 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
AlkP97793 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
AlkP97793 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
AlkP97793 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
AlkP97793 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
AlkP97793 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
AlkP97793 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
AlkP97793 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms