Protein–RNA interactions for Protein: P97784

Cry1, Cryptochrome-1, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cry1P97784 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cry1P97784 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cry1P97784 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cry1P97784 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Cry1P97784 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cry1P97784 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cry1P97784 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cry1P97784 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cry1P97784 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cry1P97784 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Cry1P97784 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cry1P97784 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cry1P97784 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cry1P97784 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cry1P97784 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Cry1P97784 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cry1P97784 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cry1P97784 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cry1P97784 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cry1P97784 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cry1P97784 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cry1P97784 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cry1P97784 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cry1P97784 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cry1P97784 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cry1P97784 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Cry1P97784 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cry1P97784 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cry1P97784 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cry1P97784 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cry1P97784 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cry1P97784 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cry1P97784 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cry1P97784 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cry1P97784 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cry1P97784 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cry1P97784 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cry1P97784 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cry1P97784 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Cry1P97784 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cry1P97784 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Cry1P97784 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cry1P97784 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cry1P97784 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cry1P97784 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cry1P97784 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cry1P97784 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cry1P97784 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cry1P97784 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cry1P97784 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cry1P97784 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cry1P97784 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Cry1P97784 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cry1P97784 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cry1P97784 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Cry1P97784 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cry1P97784 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cry1P97784 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cry1P97784 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cry1P97784 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cry1P97784 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cry1P97784 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cry1P97784 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cry1P97784 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cry1P97784 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cry1P97784 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Cry1P97784 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cry1P97784 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cry1P97784 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Cry1P97784 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Cry1P97784 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cry1P97784 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cry1P97784 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cry1P97784 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Cry1P97784 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cry1P97784 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cry1P97784 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cry1P97784 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cry1P97784 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cry1P97784 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cry1P97784 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cry1P97784 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cry1P97784 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cry1P97784 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cry1P97784 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cry1P97784 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cry1P97784 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cry1P97784 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cry1P97784 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Cry1P97784 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cry1P97784 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cry1P97784 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cry1P97784 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cry1P97784 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cry1P97784 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cry1P97784 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cry1P97784 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Cry1P97784 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cry1P97784 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cry1P97784 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms