Protein–RNA interactions for Protein: P97769

Cited1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited1P97769 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cited1P97769 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cited1P97769 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cited1P97769 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cited1P97769 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cited1P97769 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Cited1P97769 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Cited1P97769 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cited1P97769 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cited1P97769 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Cited1P97769 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cited1P97769 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Cited1P97769 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cited1P97769 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cited1P97769 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cited1P97769 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cited1P97769 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Cited1P97769 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cited1P97769 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cited1P97769 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cited1P97769 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cited1P97769 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cited1P97769 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cited1P97769 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cited1P97769 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cited1P97769 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cited1P97769 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cited1P97769 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Cited1P97769 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cited1P97769 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cited1P97769 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cited1P97769 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cited1P97769 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cited1P97769 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cited1P97769 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cited1P97769 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cited1P97769 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cited1P97769 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cited1P97769 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cited1P97769 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cited1P97769 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cited1P97769 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cited1P97769 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cited1P97769 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cited1P97769 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cited1P97769 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cited1P97769 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cited1P97769 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cited1P97769 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cited1P97769 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cited1P97769 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cited1P97769 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cited1P97769 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cited1P97769 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cited1P97769 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cited1P97769 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cited1P97769 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cited1P97769 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cited1P97769 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cited1P97769 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cited1P97769 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cited1P97769 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cited1P97769 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cited1P97769 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cited1P97769 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cited1P97769 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cited1P97769 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cited1P97769 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cited1P97769 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cited1P97769 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cited1P97769 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cited1P97769 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cited1P97769 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cited1P97769 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cited1P97769 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cited1P97769 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cited1P97769 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cited1P97769 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cited1P97769 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cited1P97769 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cited1P97769 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cited1P97769 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cited1P97769 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Cited1P97769 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cited1P97769 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cited1P97769 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cited1P97769 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cited1P97769 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cited1P97769 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cited1P97769 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cited1P97769 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cited1P97769 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cited1P97769 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cited1P97769 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cited1P97769 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cited1P97769 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cited1P97769 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cited1P97769 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cited1P97769 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cited1P97769 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms