Protein–RNA interactions for Protein: P97358

Taf1b, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1bP97358 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Taf1bP97358 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Taf1bP97358 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Taf1bP97358 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Taf1bP97358 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Taf1bP97358 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Taf1bP97358 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Taf1bP97358 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Taf1bP97358 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Taf1bP97358 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Taf1bP97358 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Taf1bP97358 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Taf1bP97358 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Taf1bP97358 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Taf1bP97358 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Taf1bP97358 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Taf1bP97358 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Taf1bP97358 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Taf1bP97358 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Taf1bP97358 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Taf1bP97358 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Taf1bP97358 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Taf1bP97358 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Taf1bP97358 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Taf1bP97358 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Taf1bP97358 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Taf1bP97358 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Taf1bP97358 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Taf1bP97358 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Taf1bP97358 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Taf1bP97358 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Taf1bP97358 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Taf1bP97358 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Taf1bP97358 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Taf1bP97358 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Taf1bP97358 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Taf1bP97358 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Taf1bP97358 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Taf1bP97358 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Taf1bP97358 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Taf1bP97358 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Taf1bP97358 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Taf1bP97358 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Taf1bP97358 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Taf1bP97358 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Taf1bP97358 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Taf1bP97358 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Taf1bP97358 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Taf1bP97358 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Taf1bP97358 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Taf1bP97358 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Taf1bP97358 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Taf1bP97358 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Taf1bP97358 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Taf1bP97358 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Taf1bP97358 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Taf1bP97358 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Taf1bP97358 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Taf1bP97358 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Taf1bP97358 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Taf1bP97358 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Taf1bP97358 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Taf1bP97358 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Taf1bP97358 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Taf1bP97358 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Taf1bP97358 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Taf1bP97358 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Taf1bP97358 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Taf1bP97358 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Taf1bP97358 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Taf1bP97358 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Taf1bP97358 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Taf1bP97358 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Taf1bP97358 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Taf1bP97358 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Taf1bP97358 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Taf1bP97358 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Taf1bP97358 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Taf1bP97358 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Taf1bP97358 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Taf1bP97358 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Taf1bP97358 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Taf1bP97358 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Taf1bP97358 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Taf1bP97358 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Taf1bP97358 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Taf1bP97358 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Taf1bP97358 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Taf1bP97358 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Taf1bP97358 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Taf1bP97358 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Taf1bP97358 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Taf1bP97358 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Taf1bP97358 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Taf1bP97358 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Taf1bP97358 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Taf1bP97358 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Taf1bP97358 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Taf1bP97358 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Taf1bP97358 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms