Protein–RNA interactions for Protein: P97355

Sms, Spermine synthase, mousemouse

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmsP97355 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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SmsP97355 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SmsP97355 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SmsP97355 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SmsP97355 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SmsP97355 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SmsP97355 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SmsP97355 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SmsP97355 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SmsP97355 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SmsP97355 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SmsP97355 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SmsP97355 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SmsP97355 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SmsP97355 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SmsP97355 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SmsP97355 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SmsP97355 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SmsP97355 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SmsP97355 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SmsP97355 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
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SmsP97355 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SmsP97355 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SmsP97355 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SmsP97355 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SmsP97355 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
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SmsP97355 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SmsP97355 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SmsP97355 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SmsP97355 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SmsP97355 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
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SmsP97355 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SmsP97355 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SmsP97355 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SmsP97355 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SmsP97355 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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SmsP97355 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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SmsP97355 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SmsP97355 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SmsP97355 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SmsP97355 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SmsP97355 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SmsP97355 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
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SmsP97355 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SmsP97355 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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SmsP97355 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SmsP97355 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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SmsP97355 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SmsP97355 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SmsP97355 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SmsP97355 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SmsP97355 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SmsP97355 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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SmsP97355 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SmsP97355 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SmsP97355 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SmsP97355 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SmsP97355 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SmsP97355 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SmsP97355 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SmsP97355 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SmsP97355 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SmsP97355 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SmsP97355 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SmsP97355 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SmsP97355 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SmsP97355 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms