Protein–RNA interactions for Protein: P83510

Tnik, Traf2 and NCK-interacting protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnikP83510 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TnikP83510 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TnikP83510 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TnikP83510 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TnikP83510 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TnikP83510 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TnikP83510 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TnikP83510 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TnikP83510 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TnikP83510 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TnikP83510 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TnikP83510 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TnikP83510 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TnikP83510 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TnikP83510 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TnikP83510 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TnikP83510 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TnikP83510 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TnikP83510 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TnikP83510 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TnikP83510 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TnikP83510 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TnikP83510 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TnikP83510 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TnikP83510 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TnikP83510 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TnikP83510 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
TnikP83510 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TnikP83510 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TnikP83510 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TnikP83510 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TnikP83510 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TnikP83510 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TnikP83510 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TnikP83510 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TnikP83510 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TnikP83510 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TnikP83510 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TnikP83510 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TnikP83510 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TnikP83510 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TnikP83510 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TnikP83510 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TnikP83510 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TnikP83510 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TnikP83510 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TnikP83510 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TnikP83510 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TnikP83510 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TnikP83510 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TnikP83510 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TnikP83510 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TnikP83510 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TnikP83510 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TnikP83510 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TnikP83510 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TnikP83510 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TnikP83510 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TnikP83510 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TnikP83510 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TnikP83510 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TnikP83510 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TnikP83510 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TnikP83510 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TnikP83510 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TnikP83510 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TnikP83510 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TnikP83510 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TnikP83510 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TnikP83510 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TnikP83510 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TnikP83510 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TnikP83510 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TnikP83510 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TnikP83510 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TnikP83510 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TnikP83510 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TnikP83510 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TnikP83510 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TnikP83510 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TnikP83510 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TnikP83510 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TnikP83510 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TnikP83510 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TnikP83510 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TnikP83510 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TnikP83510 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TnikP83510 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TnikP83510 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TnikP83510 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TnikP83510 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TnikP83510 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TnikP83510 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TnikP83510 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TnikP83510 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TnikP83510 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TnikP83510 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TnikP83510 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TnikP83510 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TnikP83510 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms