Protein–RNA interactions for Protein: P80560

Ptprn2, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2, mousemouse

Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn2P80560 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ptprn2P80560 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ptprn2P80560 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ptprn2P80560 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ptprn2P80560 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ptprn2P80560 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ptprn2P80560 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ptprn2P80560 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ptprn2P80560 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ptprn2P80560 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ptprn2P80560 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ptprn2P80560 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ptprn2P80560 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ptprn2P80560 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ptprn2P80560 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ptprn2P80560 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ptprn2P80560 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ptprn2P80560 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ptprn2P80560 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ptprn2P80560 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ptprn2P80560 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ptprn2P80560 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ptprn2P80560 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ptprn2P80560 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ptprn2P80560 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ptprn2P80560 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ptprn2P80560 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ptprn2P80560 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ptprn2P80560 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ptprn2P80560 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ptprn2P80560 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ptprn2P80560 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ptprn2P80560 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ptprn2P80560 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ptprn2P80560 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ptprn2P80560 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ptprn2P80560 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ptprn2P80560 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ptprn2P80560 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ptprn2P80560 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ptprn2P80560 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ptprn2P80560 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ptprn2P80560 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptprn2P80560 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptprn2P80560 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptprn2P80560 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptprn2P80560 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptprn2P80560 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptprn2P80560 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptprn2P80560 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptprn2P80560 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptprn2P80560 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptprn2P80560 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptprn2P80560 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
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Ptprn2P80560 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptprn2P80560 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptprn2P80560 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptprn2P80560 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptprn2P80560 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptprn2P80560 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptprn2P80560 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ptprn2P80560 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ptprn2P80560 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ptprn2P80560 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ptprn2P80560 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ptprn2P80560 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ptprn2P80560 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ptprn2P80560 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ptprn2P80560 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ptprn2P80560 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
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Ptprn2P80560 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
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Ptprn2P80560 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ptprn2P80560 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ptprn2P80560 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ptprn2P80560 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ptprn2P80560 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ptprn2P80560 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ptprn2P80560 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ptprn2P80560 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptprn2P80560 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptprn2P80560 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptprn2P80560 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptprn2P80560 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptprn2P80560 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptprn2P80560 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptprn2P80560 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptprn2P80560 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptprn2P80560 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptprn2P80560 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptprn2P80560 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptprn2P80560 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptprn2P80560 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptprn2P80560 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptprn2P80560 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptprn2P80560 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptprn2P80560 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
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