Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Otx2P80206 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Otx2P80206 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Otx2P80206 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Otx2P80206 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Otx2P80206 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Otx2P80206 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Otx2P80206 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Otx2P80206 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Otx2P80206 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Otx2P80206 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Otx2P80206 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Otx2P80206 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Otx2P80206 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Otx2P80206 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Otx2P80206 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Otx2P80206 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Otx2P80206 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Otx2P80206 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Otx2P80206 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Otx2P80206 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Otx2P80206 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Otx2P80206 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Otx2P80206 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Otx2P80206 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Otx2P80206 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Otx2P80206 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Otx2P80206 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Otx2P80206 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Otx2P80206 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Otx2P80206 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Otx2P80206 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Otx2P80206 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Otx2P80206 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Otx2P80206 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Otx2P80206 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Otx2P80206 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Otx2P80206 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Otx2P80206 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Otx2P80206 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Otx2P80206 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Otx2P80206 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Otx2P80206 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Otx2P80206 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Otx2P80206 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Otx2P80206 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Otx2P80206 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Otx2P80206 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Otx2P80206 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Otx2P80206 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Otx2P80206 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Otx2P80206 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Otx2P80206 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Otx2P80206 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Otx2P80206 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Otx2P80206 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Otx2P80206 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Otx2P80206 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Otx2P80206 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Otx2P80206 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Otx2P80206 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Otx2P80206 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Otx2P80206 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Otx2P80206 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Otx2P80206 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Otx2P80206 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Otx2P80206 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Otx2P80206 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Otx2P80206 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Otx2P80206 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Otx2P80206 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Otx2P80206 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Otx2P80206 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Otx2P80206 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Otx2P80206 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Otx2P80206 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Otx2P80206 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Otx2P80206 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Otx2P80206 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Otx2P80206 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Otx2P80206 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Otx2P80206 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Otx2P80206 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Otx2P80206 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Otx2P80206 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Otx2P80206 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Otx2P80206 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Otx2P80206 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Otx2P80206 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Otx2P80206 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Otx2P80206 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Otx2P80206 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Otx2P80206 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Otx2P80206 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Otx2P80206 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Otx2P80206 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Otx2P80206 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Otx2P80206 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Otx2P80206 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Otx2P80206 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms