Protein–RNA interactions for Protein: P70452

Stx4, Syntaxin-4, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx4P70452 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stx4P70452 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Stx4P70452 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stx4P70452 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stx4P70452 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stx4P70452 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stx4P70452 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Stx4P70452 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stx4P70452 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Stx4P70452 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stx4P70452 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stx4P70452 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stx4P70452 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stx4P70452 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stx4P70452 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Stx4P70452 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stx4P70452 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stx4P70452 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stx4P70452 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stx4P70452 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stx4P70452 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stx4P70452 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stx4P70452 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stx4P70452 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stx4P70452 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Stx4P70452 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stx4P70452 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stx4P70452 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Stx4P70452 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stx4P70452 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stx4P70452 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stx4P70452 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stx4P70452 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stx4P70452 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stx4P70452 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stx4P70452 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stx4P70452 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stx4P70452 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stx4P70452 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stx4P70452 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stx4P70452 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stx4P70452 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stx4P70452 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stx4P70452 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stx4P70452 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stx4P70452 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stx4P70452 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stx4P70452 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stx4P70452 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stx4P70452 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stx4P70452 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stx4P70452 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stx4P70452 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stx4P70452 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stx4P70452 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stx4P70452 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stx4P70452 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stx4P70452 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stx4P70452 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stx4P70452 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stx4P70452 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stx4P70452 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stx4P70452 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stx4P70452 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stx4P70452 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stx4P70452 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stx4P70452 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stx4P70452 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stx4P70452 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stx4P70452 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stx4P70452 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stx4P70452 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stx4P70452 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stx4P70452 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stx4P70452 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stx4P70452 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stx4P70452 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stx4P70452 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stx4P70452 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stx4P70452 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stx4P70452 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stx4P70452 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stx4P70452 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stx4P70452 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stx4P70452 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stx4P70452 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stx4P70452 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stx4P70452 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stx4P70452 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stx4P70452 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stx4P70452 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stx4P70452 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stx4P70452 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx4P70452 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx4P70452 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx4P70452 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx4P70452 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx4P70452 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx4P70452 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx4P70452 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms