Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tp53bp1P70399 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tp53bp1P70399 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tp53bp1P70399 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tp53bp1P70399 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tp53bp1P70399 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tp53bp1P70399 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tp53bp1P70399 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tp53bp1P70399 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tp53bp1P70399 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tp53bp1P70399 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tp53bp1P70399 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tp53bp1P70399 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tp53bp1P70399 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tp53bp1P70399 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tp53bp1P70399 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tp53bp1P70399 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tp53bp1P70399 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tp53bp1P70399 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tp53bp1P70399 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tp53bp1P70399 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Tp53bp1P70399 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tp53bp1P70399 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tp53bp1P70399 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tp53bp1P70399 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tp53bp1P70399 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tp53bp1P70399 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Tp53bp1P70399 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tp53bp1P70399 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tp53bp1P70399 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tp53bp1P70399 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tp53bp1P70399 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tp53bp1P70399 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tp53bp1P70399 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tp53bp1P70399 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tp53bp1P70399 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Tp53bp1P70399 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tp53bp1P70399 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tp53bp1P70399 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tp53bp1P70399 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tp53bp1P70399 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tp53bp1P70399 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tp53bp1P70399 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tp53bp1P70399 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tp53bp1P70399 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tp53bp1P70399 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tp53bp1P70399 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tp53bp1P70399 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tp53bp1P70399 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tp53bp1P70399 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Tp53bp1P70399 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Tp53bp1P70399 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tp53bp1P70399 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tp53bp1P70399 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tp53bp1P70399 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tp53bp1P70399 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tp53bp1P70399 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tp53bp1P70399 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tp53bp1P70399 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tp53bp1P70399 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tp53bp1P70399 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tp53bp1P70399 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tp53bp1P70399 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tp53bp1P70399 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tp53bp1P70399 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tp53bp1P70399 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tp53bp1P70399 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tp53bp1P70399 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tp53bp1P70399 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tp53bp1P70399 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tp53bp1P70399 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tp53bp1P70399 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Tp53bp1P70399 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tp53bp1P70399 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Tp53bp1P70399 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tp53bp1P70399 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tp53bp1P70399 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tp53bp1P70399 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tp53bp1P70399 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tp53bp1P70399 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tp53bp1P70399 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tp53bp1P70399 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tp53bp1P70399 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Tp53bp1P70399 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tp53bp1P70399 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tp53bp1P70399 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tp53bp1P70399 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tp53bp1P70399 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tp53bp1P70399 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tp53bp1P70399 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tp53bp1P70399 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tp53bp1P70399 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tp53bp1P70399 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tp53bp1P70399 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Tp53bp1P70399 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tp53bp1P70399 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tp53bp1P70399 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tp53bp1P70399 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tp53bp1P70399 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tp53bp1P70399 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms