Protein–RNA interactions for Protein: P70340

Smad1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad1P70340 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smad1P70340 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smad1P70340 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smad1P70340 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smad1P70340 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smad1P70340 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smad1P70340 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smad1P70340 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smad1P70340 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smad1P70340 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smad1P70340 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smad1P70340 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smad1P70340 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smad1P70340 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smad1P70340 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smad1P70340 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smad1P70340 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smad1P70340 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smad1P70340 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smad1P70340 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smad1P70340 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smad1P70340 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smad1P70340 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Smad1P70340 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smad1P70340 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smad1P70340 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smad1P70340 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smad1P70340 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smad1P70340 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smad1P70340 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smad1P70340 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smad1P70340 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smad1P70340 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smad1P70340 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smad1P70340 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Smad1P70340 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smad1P70340 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smad1P70340 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Smad1P70340 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Smad1P70340 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smad1P70340 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Smad1P70340 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smad1P70340 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smad1P70340 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smad1P70340 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smad1P70340 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smad1P70340 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smad1P70340 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smad1P70340 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smad1P70340 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smad1P70340 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smad1P70340 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smad1P70340 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smad1P70340 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smad1P70340 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smad1P70340 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smad1P70340 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smad1P70340 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smad1P70340 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smad1P70340 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Smad1P70340 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Smad1P70340 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Smad1P70340 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Smad1P70340 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Smad1P70340 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Smad1P70340 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Smad1P70340 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Smad1P70340 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smad1P70340 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smad1P70340 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smad1P70340 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smad1P70340 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Smad1P70340 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smad1P70340 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smad1P70340 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smad1P70340 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smad1P70340 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smad1P70340 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smad1P70340 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smad1P70340 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smad1P70340 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smad1P70340 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smad1P70340 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smad1P70340 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smad1P70340 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smad1P70340 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smad1P70340 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smad1P70340 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smad1P70340 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smad1P70340 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smad1P70340 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smad1P70340 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smad1P70340 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smad1P70340 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smad1P70340 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smad1P70340 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smad1P70340 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smad1P70340 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Smad1P70340 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smad1P70340 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms