Protein–RNA interactions for Protein: P70298

Cux2, Homeobox protein cut-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux2P70298 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Cux2P70298 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Cux2P70298 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Cux2P70298 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Cux2P70298 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Cux2P70298 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Cux2P70298 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Cux2P70298 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Cux2P70298 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Cux2P70298 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Cux2P70298 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Cux2P70298 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Cux2P70298 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Cux2P70298 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Cux2P70298 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Cux2P70298 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Cux2P70298 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Cux2P70298 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Cux2P70298 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Cux2P70298 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Cux2P70298 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Cux2P70298 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Cux2P70298 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Cux2P70298 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cux2P70298 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cux2P70298 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cux2P70298 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cux2P70298 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cux2P70298 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cux2P70298 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cux2P70298 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Cux2P70298 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Cux2P70298 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Cux2P70298 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Cux2P70298 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Cux2P70298 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Cux2P70298 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Cux2P70298 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Cux2P70298 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Cux2P70298 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Cux2P70298 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Cux2P70298 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Cux2P70298 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cux2P70298 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cux2P70298 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cux2P70298 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cux2P70298 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cux2P70298 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cux2P70298 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cux2P70298 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Cux2P70298 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cux2P70298 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Cux2P70298 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Cux2P70298 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Cux2P70298 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Cux2P70298 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Cux2P70298 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Cux2P70298 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Cux2P70298 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Cux2P70298 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Cux2P70298 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Cux2P70298 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Cux2P70298 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Cux2P70298 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Cux2P70298 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Cux2P70298 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Cux2P70298 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Cux2P70298 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cux2P70298 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cux2P70298 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cux2P70298 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cux2P70298 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cux2P70298 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cux2P70298 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cux2P70298 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Cux2P70298 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cux2P70298 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cux2P70298 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cux2P70298 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cux2P70298 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
Cux2P70298 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Cux2P70298 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Cux2P70298 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Cux2P70298 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Cux2P70298 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Cux2P70298 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Cux2P70298 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Cux2P70298 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Cux2P70298 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Cux2P70298 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Cux2P70298 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Cux2P70298 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Cux2P70298 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Cux2P70298 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Cux2P70298 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Cux2P70298 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Cux2P70298 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Cux2P70298 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Cux2P70298 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Cux2P70298 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms