Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxd13P70217 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxd13P70217 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxd13P70217 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxd13P70217 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxd13P70217 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxd13P70217 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxd13P70217 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxd13P70217 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxd13P70217 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxd13P70217 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxd13P70217 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxd13P70217 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxd13P70217 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxd13P70217 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxd13P70217 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxd13P70217 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxd13P70217 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxd13P70217 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxd13P70217 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxd13P70217 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxd13P70217 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxd13P70217 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxd13P70217 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxd13P70217 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxd13P70217 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxd13P70217 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxd13P70217 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxd13P70217 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxd13P70217 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxd13P70217 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxd13P70217 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxd13P70217 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxd13P70217 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxd13P70217 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxd13P70217 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxd13P70217 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxd13P70217 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxd13P70217 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxd13P70217 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxd13P70217 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxd13P70217 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxd13P70217 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxd13P70217 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxd13P70217 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxd13P70217 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxd13P70217 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxd13P70217 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxd13P70217 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxd13P70217 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxd13P70217 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxd13P70217 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxd13P70217 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxd13P70217 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxd13P70217 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxd13P70217 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxd13P70217 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxd13P70217 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxd13P70217 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxd13P70217 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxd13P70217 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxd13P70217 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxd13P70217 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Hoxd13P70217 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxd13P70217 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxd13P70217 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxd13P70217 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxd13P70217 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxd13P70217 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxd13P70217 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxd13P70217 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxd13P70217 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxd13P70217 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxd13P70217 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxd13P70217 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxd13P70217 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxd13P70217 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxd13P70217 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxd13P70217 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxd13P70217 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxd13P70217 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxd13P70217 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxd13P70217 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxd13P70217 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxd13P70217 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxd13P70217 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxd13P70217 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxd13P70217 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxd13P70217 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxd13P70217 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxd13P70217 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxd13P70217 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxd13P70217 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxd13P70217 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxd13P70217 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxd13P70217 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxd13P70217 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxd13P70217 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxd13P70217 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxd13P70217 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms