Protein–RNA interactions for Protein: P70211

Dcc, Netrin receptor DCC, mousemouse

Predictions only

Length 1,447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DccP70211 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
DccP70211 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DccP70211 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DccP70211 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DccP70211 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DccP70211 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DccP70211 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DccP70211 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DccP70211 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
DccP70211 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DccP70211 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DccP70211 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DccP70211 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
DccP70211 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
DccP70211 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DccP70211 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DccP70211 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DccP70211 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DccP70211 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DccP70211 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DccP70211 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DccP70211 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DccP70211 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DccP70211 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DccP70211 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DccP70211 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DccP70211 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
DccP70211 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DccP70211 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DccP70211 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DccP70211 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
DccP70211 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DccP70211 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DccP70211 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DccP70211 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DccP70211 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DccP70211 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DccP70211 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DccP70211 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DccP70211 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DccP70211 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DccP70211 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DccP70211 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DccP70211 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DccP70211 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DccP70211 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DccP70211 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DccP70211 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DccP70211 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DccP70211 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DccP70211 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DccP70211 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DccP70211 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DccP70211 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DccP70211 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DccP70211 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
DccP70211 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DccP70211 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DccP70211 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
DccP70211 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DccP70211 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DccP70211 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DccP70211 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DccP70211 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DccP70211 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DccP70211 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DccP70211 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DccP70211 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DccP70211 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DccP70211 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DccP70211 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
DccP70211 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
DccP70211 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DccP70211 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
DccP70211 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DccP70211 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DccP70211 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DccP70211 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DccP70211 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DccP70211 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DccP70211 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DccP70211 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DccP70211 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DccP70211 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
DccP70211 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DccP70211 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
DccP70211 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
DccP70211 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
DccP70211 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
DccP70211 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
DccP70211 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DccP70211 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DccP70211 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DccP70211 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DccP70211 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DccP70211 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DccP70211 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DccP70211 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DccP70211 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DccP70211 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms